More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4354 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  100 
 
 		 396 aa  776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  80.66 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  57.51 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 		 374 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 391 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  50.88 
 
 		 383 aa  346  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  51.13 
 
 		 404 aa  342  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  50.51 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  52.11 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  48 
 
 		 389 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  50.38 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  48.37 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  52.02 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  46.89 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  52.02 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  52.02 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  50.54 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  46.43 
 
 		 373 aa  302  8.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  41.21 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  41.21 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  40.55 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.21 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.94 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.94 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 		 385 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 		 374 aa  269  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  39.07 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  39.59 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.27 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  39.21 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  38.93 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  38.74 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  37.21 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  42.15 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  54.98 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  38.48 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  41.58 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  39.16 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  39.05 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  39.12 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  38.27 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 379 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  42.06 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  41.95 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  39.59 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  39.38 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  40.37 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  41.1 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.06 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  39.53 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  38.68 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  39.33 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  38.32 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 		 388 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  39.58 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  37.53 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  41.16 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  39.53 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  40.46 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>