158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0876 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50.8 
 
 		 730 aa  640    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 732 aa  1440    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  53.29 
 
 		 725 aa  723    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  73.71 
 
 		 735 aa  1040    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.95 
 
 		 731 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  35.38 
 
 		 637 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  34 
 
 		 707 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  33.67 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  35.03 
 
 		 634 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  32.08 
 
 		 722 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  33.4 
 
 		 641 aa  247  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  34.22 
 
 		 636 aa  244  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  31.18 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  30.59 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  33.93 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  30.27 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 648 aa  228  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  32.5 
 
 		 611 aa  224  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  31.94 
 
 		 612 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  28.92 
 
 		 758 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  28.79 
 
 		 761 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  28.32 
 
 		 612 aa  211  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  30.16 
 
 		 612 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  40.28 
 
 		 720 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  40.24 
 
 		 773 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  41.77 
 
 		 766 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  42.86 
 
 		 756 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 749 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  47.54 
 
 		 864 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  49.18 
 
 		 718 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.74 
 
 		 514 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  40 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.62 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  38.89 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1854  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.42 
 
 		 716 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  34.82 
 
 		 772 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6672  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.9 
 
 		 901 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 501 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.29 
 
 		 695 aa  48.5  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7595  RNA binding S1 domain protein  44.44 
 
 		 797 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  45.9 
 
 		 784 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  45.9 
 
 		 775 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 706 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 706 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 706 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  35.35 
 
 		 718 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0330  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.84 
 
 		 1538 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  34.62 
 
 		 759 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 705 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 722 aa  47.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  44.26 
 
 		 795 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.24 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  36.71 
 
 		 779 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34820  transcriptional accessory protein  45.07 
 
 		 816 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 711 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  36.71 
 
 		 770 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 702 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 742 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.554464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  36.71 
 
 		 779 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  44.26 
 
 		 838 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2482  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.14 
 
 		 772 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.676792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  41.89 
 
 		 782 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  42.62 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 754 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  40 
 
 		 723 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  39.74 
 
 		 783 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.85 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.35 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3604  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0558589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  36.62 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.85 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.35 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0021  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.03 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000787373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.26 
 
 		 776 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  39.19 
 
 		 779 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  40 
 
 		 767 aa  45.8  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 598 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.34 
 
 		 713 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.27 
 
 		 700 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40 
 
 		 672 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  39.19 
 
 		 777 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>