More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1676 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.42 
 
 		 724 aa  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  56.69 
 
 		 722 aa  808    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  47.55 
 
 		 719 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  47.55 
 
 		 719 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 716 aa  1452    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  56.55 
 
 		 722 aa  810    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.52 
 
 		 713 aa  720    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  49.52 
 
 		 720 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  56.69 
 
 		 724 aa  808    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  56.69 
 
 		 724 aa  808    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  56.69 
 
 		 724 aa  808    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  56.55 
 
 		 721 aa  809    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.65 
 
 		 713 aa  709    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.71 
 
 		 722 aa  701    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  56.27 
 
 		 722 aa  813    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  51.86 
 
 		 718 aa  717    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  45.4 
 
 		 717 aa  655    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  56.55 
 
 		 722 aa  806    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.81 
 
 		 712 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.95 
 
 		 713 aa  734    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  56.23 
 
 		 722 aa  813    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  53.45 
 
 		 722 aa  746    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  56.41 
 
 		 724 aa  815    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  49.1 
 
 		 720 aa  696    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  49.24 
 
 		 720 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  52.57 
 
 		 718 aa  757    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.41 
 
 		 722 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.64 
 
 		 722 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  50.78 
 
 		 713 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  49.51 
 
 		 730 aa  684    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  50 
 
 		 710 aa  674    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  76.68 
 
 		 716 aa  1131    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.74 
 
 		 722 aa  812    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  48.28 
 
 		 727 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  58 
 
 		 728 aa  814    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 726 aa  713    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  51.4 
 
 		 718 aa  739    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  49.08 
 
 		 721 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  52.05 
 
 		 721 aa  741    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  76.68 
 
 		 716 aa  1131    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.01 
 
 		 706 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.89 
 
 		 761 aa  628  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  46.91 
 
 		 762 aa  627  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.48 
 
 		 720 aa  625  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  45.53 
 
 		 718 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.03 
 
 		 723 aa  625  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  44.49 
 
 		 757 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  43.29 
 
 		 736 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  43.82 
 
 		 762 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.46 
 
 		 759 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.29 
 
 		 757 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf783  transcription accessory protein Tex  43.64 
 
 		 717 aa  593  1e-168  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  45.75 
 
 		 705 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  44.54 
 
 		 699 aa  590  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.17 
 
 		 754 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  43.02 
 
 		 763 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  46.48 
 
 		 754 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  43.56 
 
 		 704 aa  587  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  43.65 
 
 		 713 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.64 
 
 		 780 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  42.9 
 
 		 765 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  46.2 
 
 		 756 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.7 
 
 		 781 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.9 
 
 		 759 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  43.47 
 
 		 710 aa  582  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  42.17 
 
 		 773 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  42.7 
 
 		 782 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  43.6 
 
 		 707 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  42.56 
 
 		 784 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  42.37 
 
 		 773 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  42.66 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  44.77 
 
 		 775 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  42.56 
 
 		 821 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  41.12 
 
 		 703 aa  570  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  42.86 
 
 		 766 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  43.26 
 
 		 760 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  42.66 
 
 		 775 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  42.26 
 
 		 772 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  42.78 
 
 		 777 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.64 
 
 		 788 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  42.59 
 
 		 719 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  41.68 
 
 		 787 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  42.38 
 
 		 815 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  42.01 
 
 		 801 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  42.27 
 
 		 772 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  42.37 
 
 		 777 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  42.27 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  42.46 
 
 		 773 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.24 
 
 		 815 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  41.3 
 
 		 777 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  41.99 
 
 		 719 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  41.77 
 
 		 791 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  41.6 
 
 		 795 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.38 
 
 		 774 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.19 
 
 		 813 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>