More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1095 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.68 
 
 		 716 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  48.07 
 
 		 722 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  48.69 
 
 		 718 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 762 aa  1511    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.42 
 
 		 716 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  48.97 
 
 		 718 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 724 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.34 
 
 		 726 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.24 
 
 		 712 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  46.8 
 
 		 721 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.49 
 
 		 713 aa  636    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.66 
 
 		 722 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  64.95 
 
 		 721 aa  914    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.42 
 
 		 716 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.95 
 
 		 722 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  50.14 
 
 		 722 aa  688    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.11 
 
 		 713 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  48.42 
 
 		 722 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.42 
 
 		 713 aa  634  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.14 
 
 		 722 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  48.35 
 
 		 721 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  47.03 
 
 		 718 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  48.29 
 
 		 724 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.69 
 
 		 722 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  46.75 
 
 		 720 aa  635  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.28 
 
 		 724 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  48.28 
 
 		 724 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  48.42 
 
 		 724 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  48.28 
 
 		 722 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  48.14 
 
 		 722 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  47.03 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 		 722 aa  621  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  45.41 
 
 		 727 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  47.99 
 
 		 728 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  42.91 
 
 		 773 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  45.73 
 
 		 760 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  47.03 
 
 		 713 aa  601  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.04 
 
 		 761 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  44.77 
 
 		 736 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  43.23 
 
 		 772 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  47.33 
 
 		 720 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  43.03 
 
 		 773 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  43.83 
 
 		 705 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.49 
 
 		 720 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  44.57 
 
 		 717 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  46.04 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.03 
 
 		 780 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  45.69 
 
 		 730 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 710 aa  588  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  46.04 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  42.02 
 
 		 757 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  42.31 
 
 		 787 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.82 
 
 		 723 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  45.6 
 
 		 718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  42.33 
 
 		 782 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  41.7 
 
 		 766 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.45 
 
 		 774 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  42.42 
 
 		 772 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  42.68 
 
 		 802 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  42.6 
 
 		 763 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 781 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  42.33 
 
 		 778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  42.01 
 
 		 777 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  40.96 
 
 		 772 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  40.94 
 
 		 773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  40.68 
 
 		 773 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  40.32 
 
 		 777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  42.19 
 
 		 777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.96 
 
 		 773 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  40.96 
 
 		 773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  40.7 
 
 		 773 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  40.96 
 
 		 773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  41.29 
 
 		 772 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  41.58 
 
 		 767 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  41.09 
 
 		 773 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  40.96 
 
 		 773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  42.51 
 
 		 795 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  40.83 
 
 		 773 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  42.31 
 
 		 776 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.75 
 
 		 777 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  40.34 
 
 		 772 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  45.24 
 
 		 719 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  42.88 
 
 		 759 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  42.31 
 
 		 776 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.67 
 
 		 804 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.86 
 
 		 757 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  44.44 
 
 		 719 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  42.18 
 
 		 776 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  40.87 
 
 		 791 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  42.17 
 
 		 762 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  45.32 
 
 		 699 aa  567  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  42.19 
 
 		 765 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  42.31 
 
 		 774 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  42.04 
 
 		 776 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  42.18 
 
 		 776 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  41.88 
 
 		 780 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  41.09 
 
 		 775 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  42.88 
 
 		 777 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.87 
 
 		 791 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  40.87 
 
 		 791 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>