More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0732 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.88 
 
 
713 aa  656    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  48.89 
 
 
721 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  49.72 
 
 
718 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  51.68 
 
 
722 aa  702    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
716 aa  682    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.72 
 
 
713 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.68 
 
 
722 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  100 
 
 
720 aa  1453    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  51.4 
 
 
722 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.46 
 
 
726 aa  695    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.68 
 
 
724 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  51.68 
 
 
724 aa  703    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  51.68 
 
 
724 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.14 
 
 
724 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.68 
 
 
722 aa  698    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  49.38 
 
 
722 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  51.54 
 
 
722 aa  701    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.37 
 
 
722 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  53.74 
 
 
728 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  50.98 
 
 
722 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  47.28 
 
 
720 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.51 
 
 
713 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  49.17 
 
 
718 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  63.88 
 
 
713 aa  895    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  50.49 
 
 
730 aa  688    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  76.68 
 
 
710 aa  1093    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 
716 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 
716 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.62 
 
 
722 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  49.17 
 
 
718 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.63 
 
 
712 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.62 
 
 
722 aa  640    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  53.18 
 
 
721 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  51.68 
 
 
724 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  46.74 
 
 
720 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  47.33 
 
 
762 aa  600  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.37 
 
 
706 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  45.53 
 
 
717 aa  594  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.4 
 
 
720 aa  591  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  45.5 
 
 
802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  44.68 
 
 
727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  45.79 
 
 
777 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  45.02 
 
 
787 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  45.65 
 
 
788 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  43.34 
 
 
773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  44.78 
 
 
798 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  44.86 
 
 
779 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  44.67 
 
 
782 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.67 
 
 
781 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  45.12 
 
 
773 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  44.57 
 
 
784 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.4 
 
 
780 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  44.86 
 
 
777 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.39 
 
 
774 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  45.49 
 
 
772 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  46.65 
 
 
821 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  44.86 
 
 
765 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  44.64 
 
 
799 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  45.27 
 
 
773 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  46.65 
 
 
774 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  45.84 
 
 
789 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  46.51 
 
 
759 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.35 
 
 
723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0772  RNA binding S1 domain protein  43.32 
 
 
771 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.17 
 
 
761 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  45.05 
 
 
773 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  45.49 
 
 
789 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  45.05 
 
 
772 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  46.21 
 
 
774 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  45.69 
 
 
772 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  45.31 
 
 
795 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.97 
 
 
812 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.36 
 
 
813 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  44.98 
 
 
766 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  46.06 
 
 
815 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0813  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.67 
 
 
771 aa  562  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179863  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  46.53 
 
 
719 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  46.53 
 
 
719 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.29 
 
 
767 aa  561  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.61 
 
 
774 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.36 
 
 
774 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.06 
 
 
774 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  45.42 
 
 
778 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.92 
 
 
815 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  42.7 
 
 
777 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  44.72 
 
 
774 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  45.92 
 
 
775 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  45.15 
 
 
721 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.37 
 
 
861 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  44.61 
 
 
770 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  45.08 
 
 
757 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.23 
 
 
774 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  43.34 
 
 
782 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  44.28 
 
 
779 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.56 
 
 
774 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>