More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1469 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.12 
 
 		 713 aa  748    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 716 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.53 
 
 		 716 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  52.12 
 
 		 718 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.4 
 
 		 722 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  51.4 
 
 		 724 aa  737    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.26 
 
 		 724 aa  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  51.26 
 
 		 724 aa  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  51.26 
 
 		 724 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  53.94 
 
 		 721 aa  751    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.92 
 
 		 724 aa  725    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  52.51 
 
 		 718 aa  742    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 722 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 722 aa  731    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.98 
 
 		 713 aa  742    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  51.12 
 
 		 722 aa  727    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  50.97 
 
 		 722 aa  731    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.1 
 
 		 712 aa  747    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  51.9 
 
 		 728 aa  685    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.79 
 
 		 722 aa  711    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  52.93 
 
 		 718 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  53.06 
 
 		 720 aa  780    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  53.06 
 
 		 720 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 717 aa  1436    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  52.67 
 
 		 721 aa  690    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 716 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.37 
 
 		 722 aa  748    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.4 
 
 		 720 aa  640    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  51.12 
 
 		 722 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  51.26 
 
 		 722 aa  729    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.98 
 
 		 713 aa  754    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  52.67 
 
 		 722 aa  732    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  48.24 
 
 		 777 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.03 
 
 		 726 aa  635  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  47.78 
 
 		 773 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  49.18 
 
 		 767 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  46.64 
 
 		 762 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 774 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  47.19 
 
 		 798 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  44.12 
 
 		 727 aa  621  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  45.69 
 
 		 730 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  46.81 
 
 		 773 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.25 
 
 		 787 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  45.81 
 
 		 775 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  46.87 
 
 		 799 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.86 
 
 		 766 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  46.86 
 
 		 713 aa  611  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.8 
 
 		 723 aa  611  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.74 
 
 		 761 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  46.39 
 
 		 765 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.3 
 
 		 759 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.08 
 
 		 757 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  46.21 
 
 		 772 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  46.95 
 
 		 787 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.72 
 
 		 754 aa  607  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  46.11 
 
 		 736 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  47.03 
 
 		 779 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  47.06 
 
 		 757 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.21 
 
 		 706 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  45.21 
 
 		 778 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  47.59 
 
 		 802 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  47.81 
 
 		 770 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.59 
 
 		 782 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 710 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  45.43 
 
 		 705 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  46.34 
 
 		 772 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  43.82 
 
 		 760 aa  598  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.99 
 
 		 787 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  46.67 
 
 		 782 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  46.61 
 
 		 754 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  46.19 
 
 		 771 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.92 
 
 		 767 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.8 
 
 		 772 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  46.54 
 
 		 718 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.52 
 
 		 804 aa  598  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0462  RNA binding S1 domain protein  49.18 
 
 		 769 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.22 
 
 		 769 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.9 
 
 		 776 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  46.99 
 
 		 777 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  48.5 
 
 		 773 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  45.86 
 
 		 787 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.23 
 
 		 772 aa  595  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.5 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.01 
 
 		 803 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  48.34 
 
 		 769 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  48.61 
 
 		 769 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.84 
 
 		 780 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  47.8 
 
 		 795 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0686  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 		 768 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.72 
 
 		 787 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  47.74 
 
 		 774 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.61 
 
 		 759 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4188  RNA binding S1 domain protein  48.62 
 
 		 769 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  47.4 
 
 		 789 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  47.05 
 
 		 773 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  47.74 
 
 		 774 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  47.74 
 
 		 774 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  46.4 
 
 		 777 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  46.75 
 
 		 793 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.54 
 
 		 723 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>