More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0338 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  62.92 
 
 		 713 aa  907    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  63.38 
 
 		 718 aa  904    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  52.37 
 
 		 717 aa  734    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.42 
 
 		 761 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  47.77 
 
 		 788 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.41 
 
 		 716 aa  702    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  47.86 
 
 		 779 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  54.76 
 
 		 722 aa  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  56.97 
 
 		 722 aa  803    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  50.62 
 
 		 720 aa  652    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  54.34 
 
 		 724 aa  755    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  54.34 
 
 		 724 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  54.34 
 
 		 724 aa  755    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.44 
 
 		 724 aa  749    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  54.34 
 
 		 722 aa  755    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  54.76 
 
 		 722 aa  775    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  47.27 
 
 		 777 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  48.04 
 
 		 802 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  62 
 
 		 718 aa  876    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  48.3 
 
 		 777 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  50.14 
 
 		 756 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  49.52 
 
 		 759 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  48.26 
 
 		 762 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  50.55 
 
 		 757 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  54.21 
 
 		 722 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.31 
 
 		 722 aa  781    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  55.68 
 
 		 721 aa  800    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  62.78 
 
 		 713 aa  904    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.93 
 
 		 716 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.95 
 
 		 772 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  46.81 
 
 		 782 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.06 
 
 		 722 aa  762    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.96 
 
 		 781 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  48.54 
 
 		 718 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 720 aa  665    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  49.26 
 
 		 787 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  49.86 
 
 		 754 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 726 aa  683    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  48.9 
 
 		 727 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  59.42 
 
 		 720 aa  844    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  59.56 
 
 		 720 aa  843    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  54.62 
 
 		 722 aa  771    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  54.76 
 
 		 724 aa  764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  59.97 
 
 		 712 aa  857    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  49.66 
 
 		 713 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  47.71 
 
 		 730 aa  646    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  51.11 
 
 		 710 aa  666    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  63.06 
 
 		 713 aa  917    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  48.95 
 
 		 719 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.75 
 
 		 706 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.89 
 
 		 723 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  55.77 
 
 		 718 aa  798    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.93 
 
 		 716 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  62.22 
 
 		 722 aa  889    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  55.89 
 
 		 728 aa  729    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  55.54 
 
 		 721 aa  737    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.03 
 
 		 773 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  47.77 
 
 		 777 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  48.95 
 
 		 719 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.35 
 
 		 757 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 722 aa  1448    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  47.66 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.28 
 
 		 780 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  48.14 
 
 		 767 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.8 
 
 		 773 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  47.82 
 
 		 782 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  47.66 
 
 		 773 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  47.47 
 
 		 795 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.55 
 
 		 767 aa  634  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.94 
 
 		 777 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  47.8 
 
 		 773 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  47.89 
 
 		 783 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  47.66 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  47.66 
 
 		 773 aa  632  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  47.6 
 
 		 766 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  47.12 
 
 		 773 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  47.85 
 
 		 776 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  47.85 
 
 		 776 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  47.53 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  48.16 
 
 		 780 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  47.95 
 
 		 762 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  47.85 
 
 		 776 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  47.85 
 
 		 776 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  47.66 
 
 		 773 aa  632  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  48.28 
 
 		 699 aa  625  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  47.35 
 
 		 777 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  47.38 
 
 		 719 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  46.13 
 
 		 797 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  47.95 
 
 		 773 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  47.25 
 
 		 773 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  48.97 
 
 		 721 aa  627  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  46.58 
 
 		 772 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  47.71 
 
 		 776 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.5 
 
 		 784 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.55 
 
 		 774 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  47.47 
 
 		 775 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  45.13 
 
 		 736 aa  624  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  46.38 
 
 		 778 aa  623  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.95 
 
 		 773 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  46.51 
 
 		 791 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>