More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1124 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 724 aa  1467    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  53.92 
 
 		 717 aa  736    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.74 
 
 		 722 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.88 
 
 		 761 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  57.88 
 
 		 721 aa  801    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.46 
 
 		 726 aa  718    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.42 
 
 		 716 aa  740    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.26 
 
 		 722 aa  820    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  55.84 
 
 		 722 aa  807    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  50.14 
 
 		 720 aa  686    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  48.12 
 
 		 727 aa  674    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  55.7 
 
 		 724 aa  806    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  55.7 
 
 		 724 aa  806    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  55.84 
 
 		 724 aa  806    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  49.1 
 
 		 762 aa  649    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  55.7 
 
 		 724 aa  815    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  49.51 
 
 		 821 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.29 
 
 		 712 aa  797    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  48.06 
 
 		 757 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.77 
 
 		 722 aa  794    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 722 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  57.88 
 
 		 728 aa  791    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  48.55 
 
 		 766 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  55.84 
 
 		 722 aa  815    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  55.7 
 
 		 722 aa  805    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  57.24 
 
 		 721 aa  830    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  48.2 
 
 		 788 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  55.91 
 
 		 718 aa  808    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  47.99 
 
 		 762 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  57.74 
 
 		 722 aa  816    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.84 
 
 		 780 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.57 
 
 		 787 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.15 
 
 		 713 aa  804    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  55.98 
 
 		 722 aa  820    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.34 
 
 		 777 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.66 
 
 		 754 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  53.27 
 
 		 720 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  53.27 
 
 		 720 aa  786    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  50.28 
 
 		 721 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  57.94 
 
 		 718 aa  831    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.42 
 
 		 713 aa  822    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.44 
 
 		 722 aa  775    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  50.35 
 
 		 713 aa  697    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  50.7 
 
 		 730 aa  690    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  50 
 
 		 710 aa  680    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.26 
 
 		 716 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  48.82 
 
 		 773 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.26 
 
 		 716 aa  755    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.86 
 
 		 723 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.27 
 
 		 773 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  47.84 
 
 		 699 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  65.14 
 
 		 718 aa  917    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  49.51 
 
 		 774 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.43 
 
 		 713 aa  803    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 706 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  46.92 
 
 		 736 aa  634  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.29 
 
 		 720 aa  633  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.26 
 
 		 759 aa  634  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.2 
 
 		 759 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  49.37 
 
 		 775 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.59 
 
 		 757 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  46.77 
 
 		 779 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 812 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  47.24 
 
 		 777 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  48.82 
 
 		 774 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.77 
 
 		 772 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.29 
 
 		 781 aa  628  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.24 
 
 		 774 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  45.82 
 
 		 763 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  46.74 
 
 		 802 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  47.49 
 
 		 765 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  47.15 
 
 		 782 aa  625  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  46.35 
 
 		 719 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.68 
 
 		 813 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  46.35 
 
 		 719 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  46.6 
 
 		 775 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.68 
 
 		 774 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.4 
 
 		 774 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  47.44 
 
 		 770 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  46.96 
 
 		 773 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  48.33 
 
 		 754 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  46.72 
 
 		 774 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  48.4 
 
 		 815 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.03 
 
 		 767 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.4 
 
 		 815 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  47.17 
 
 		 788 aa  621  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  47.09 
 
 		 773 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  47.51 
 
 		 789 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  47.38 
 
 		 789 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  46.24 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.74 
 
 		 784 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  45.82 
 
 		 718 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  46.62 
 
 		 783 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  46.31 
 
 		 772 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  46.45 
 
 		 798 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>