More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0354 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.91 
 
 		 724 aa  793    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  47.46 
 
 		 772 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  47.46 
 
 		 773 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.88 
 
 		 726 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.36 
 
 		 761 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  55.49 
 
 		 722 aa  803    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  48.6 
 
 		 754 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.4 
 
 		 716 aa  746    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  47.46 
 
 		 773 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  47.58 
 
 		 779 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 722 aa  794    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  46.35 
 
 		 762 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  49.17 
 
 		 720 aa  648    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  47.88 
 
 		 767 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.14 
 
 		 815 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  47.04 
 
 		 773 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  56.34 
 
 		 724 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  56.34 
 
 		 724 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  56.2 
 
 		 724 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  47.26 
 
 		 776 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  47.46 
 
 		 773 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  46.91 
 
 		 772 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.17 
 
 		 777 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  46.83 
 
 		 778 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  47.72 
 
 		 772 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  46.77 
 
 		 777 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  49.52 
 
 		 802 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  47.33 
 
 		 773 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.56 
 
 		 812 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  47.99 
 
 		 719 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  48.69 
 
 		 821 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  48.54 
 
 		 765 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  46.49 
 
 		 774 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.43 
 
 		 774 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  49.16 
 
 		 759 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  48.28 
 
 		 774 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  47.71 
 
 		 757 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.22 
 
 		 716 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  56.2 
 
 		 722 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.16 
 
 		 722 aa  808    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  47.25 
 
 		 772 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  48.42 
 
 		 775 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.66 
 
 		 772 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.14 
 
 		 782 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.76 
 
 		 773 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.95 
 
 		 772 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  46.16 
 
 		 782 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  49.24 
 
 		 727 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.28 
 
 		 781 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.53 
 
 		 713 aa  872    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  47.26 
 
 		 776 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.28 
 
 		 712 aa  897    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  47.05 
 
 		 778 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  47.6 
 
 		 773 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  49.32 
 
 		 787 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  74.23 
 
 		 718 aa  1110    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.8 
 
 		 774 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  48.28 
 
 		 815 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.22 
 
 		 716 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  45.7 
 
 		 775 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  48.17 
 
 		 772 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  47.33 
 
 		 773 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  59.31 
 
 		 720 aa  886    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  59.31 
 
 		 720 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.03 
 
 		 767 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.67 
 
 		 713 aa  890    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  59.53 
 
 		 722 aa  857    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.48 
 
 		 780 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  47.26 
 
 		 776 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  56.06 
 
 		 724 aa  807    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.08 
 
 		 713 aa  874    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.01 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  47.12 
 
 		 776 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  50.92 
 
 		 713 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  48.28 
 
 		 730 aa  671    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  50.07 
 
 		 710 aa  651    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  48.75 
 
 		 766 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 774 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  62 
 
 		 722 aa  888    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.46 
 
 		 773 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.63 
 
 		 774 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.59 
 
 		 723 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  47.26 
 
 		 776 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.11 
 
 		 786 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.77 
 
 		 774 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.24 
 
 		 720 aa  649    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.37 
 
 		 777 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.34 
 
 		 774 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.85 
 
 		 757 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.3 
 
 		 778 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.51 
 
 		 706 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.07 
 
 		 722 aa  777    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.01 
 
 		 813 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  47.63 
 
 		 786 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  48.83 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>