More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0233 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  69.22 
 
 
728 aa  977    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.06 
 
 
722 aa  768    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.65 
 
 
761 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  56.74 
 
 
716 aa  820    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  90.58 
 
 
722 aa  1324    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 
705 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  51.82 
 
 
720 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  90.58 
 
 
722 aa  1319    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  55.31 
 
 
718 aa  791    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  90.58 
 
 
724 aa  1319    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  90.58 
 
 
724 aa  1319    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  90.44 
 
 
724 aa  1319    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  46.91 
 
 
718 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.21 
 
 
713 aa  771    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.74 
 
 
724 aa  796    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  91.41 
 
 
722 aa  1351    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  54.76 
 
 
718 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  91.69 
 
 
722 aa  1359    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  50.14 
 
 
759 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  50 
 
 
757 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.49 
 
 
713 aa  772    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  90.58 
 
 
722 aa  1318    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.99 
 
 
726 aa  776    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  51.8 
 
 
727 aa  714    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  48.89 
 
 
762 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.92 
 
 
713 aa  785    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  58.05 
 
 
721 aa  812    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  52.8 
 
 
720 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  52.8 
 
 
720 aa  738    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 
721 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.88 
 
 
716 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  68.58 
 
 
721 aa  984    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 
722 aa  1466    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  51.4 
 
 
713 aa  693    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  49.58 
 
 
730 aa  684    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  51.04 
 
 
710 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.88 
 
 
712 aa  744    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.6 
 
 
723 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  55.57 
 
 
722 aa  786    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.88 
 
 
716 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  86.57 
 
 
722 aa  1300    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  90.17 
 
 
724 aa  1338    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.72 
 
 
757 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 
717 aa  705    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.53 
 
 
722 aa  750    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  55.18 
 
 
718 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.43 
 
 
759 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  46.64 
 
 
719 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  46.64 
 
 
719 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.98 
 
 
706 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  49.51 
 
 
754 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  48.69 
 
 
762 aa  625  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  46.07 
 
 
719 aa  622  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  48.17 
 
 
775 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  50 
 
 
756 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  45.43 
 
 
773 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.38 
 
 
754 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  45.35 
 
 
766 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.53 
 
 
720 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  45.19 
 
 
773 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  44.49 
 
 
736 aa  603  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  43.98 
 
 
763 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.65 
 
 
788 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  46.38 
 
 
817 aa  599  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  46.26 
 
 
760 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  45.08 
 
 
719 aa  601  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  45.87 
 
 
777 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  45.59 
 
 
788 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  45.21 
 
 
779 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 
782 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.83 
 
 
781 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.44 
 
 
780 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  43.65 
 
 
797 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  46.7 
 
 
801 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  45.39 
 
 
802 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  45.12 
 
 
787 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  43.97 
 
 
838 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  45.97 
 
 
821 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  46.31 
 
 
713 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  43.41 
 
 
782 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  45.83 
 
 
774 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.59 
 
 
813 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  43.99 
 
 
765 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  46.53 
 
 
774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  44.28 
 
 
778 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.59 
 
 
774 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  44.01 
 
 
795 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  44.77 
 
 
783 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  42.54 
 
 
799 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  42.82 
 
 
798 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  46.39 
 
 
815 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.39 
 
 
815 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.39 
 
 
774 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.08 
 
 
777 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.17 
 
 
861 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>