More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3345 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.13 
 
 		 713 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  49.93 
 
 		 721 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  48.1 
 
 		 718 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 724 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  47.91 
 
 		 718 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 716 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  47.72 
 
 		 718 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.77 
 
 		 713 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  45.75 
 
 		 720 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  45.75 
 
 		 720 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.75 
 
 		 722 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 706 aa  1420    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.27 
 
 		 712 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  49.09 
 
 		 722 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.41 
 
 		 713 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 716 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.01 
 
 		 716 aa  634  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.18 
 
 		 722 aa  634  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.69 
 
 		 722 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  47.11 
 
 		 724 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  46.69 
 
 		 722 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.83 
 
 		 722 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  46.4 
 
 		 722 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  50.37 
 
 		 721 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.83 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  46.83 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  46.83 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  46.69 
 
 		 722 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  46.83 
 
 		 722 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.84 
 
 		 722 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  49.93 
 
 		 728 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.63 
 
 		 726 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  46.19 
 
 		 736 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  46.09 
 
 		 730 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  45.9 
 
 		 773 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  46.92 
 
 		 713 aa  595  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  46.36 
 
 		 765 aa  589  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  47.21 
 
 		 717 aa  592  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.19 
 
 		 766 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  45.57 
 
 		 773 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  45.5 
 
 		 720 aa  582  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.46 
 
 		 784 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  46.05 
 
 		 795 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  43.9 
 
 		 775 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  44.92 
 
 		 727 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  45.01 
 
 		 782 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.92 
 
 		 754 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  43.64 
 
 		 699 aa  572  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  43.76 
 
 		 788 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  44.61 
 
 		 798 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  45.32 
 
 		 797 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  42.94 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  45.45 
 
 		 785 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  43.83 
 
 		 721 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  42.94 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  43.98 
 
 		 718 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.38 
 
 		 773 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  45.11 
 
 		 799 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  45.43 
 
 		 775 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  43.15 
 
 		 775 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.58 
 
 		 776 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  46.73 
 
 		 801 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.41 
 
 		 720 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  44.38 
 
 		 772 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  44.38 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  44.23 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  44.57 
 
 		 779 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  45.91 
 
 		 777 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  44.75 
 
 		 802 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  44.38 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  44.55 
 
 		 778 aa  559  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  44.38 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  44.81 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  44.38 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  44.61 
 
 		 787 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  44.95 
 
 		 788 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  44.43 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  44.38 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.89 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  44.38 
 
 		 773 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  43.96 
 
 		 778 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  44.38 
 
 		 773 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.77 
 
 		 772 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.1 
 
 		 798 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  44.35 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  44.35 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  46.28 
 
 		 773 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.05 
 
 		 804 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  44.54 
 
 		 772 aa  558  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.17 
 
 		 773 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 710 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  44.35 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  44.35 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34820  transcriptional accessory protein  45.74 
 
 		 816 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.64 
 
 		 772 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 735 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  44.07 
 
 		 705 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.06 
 
 		 780 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.78 
 
 		 788 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  44.4 
 
 		 773 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>