More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0235 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.8 
 
 		 787 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  52.05 
 
 		 772 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  51.92 
 
 		 773 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 761 aa  1513    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.77 
 
 		 861 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.16 
 
 		 803 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.25 
 
 		 713 aa  685    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.94 
 
 		 735 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1042  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.12 
 
 		 794 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.889463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  49.61 
 
 		 779 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 722 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  51.4 
 
 		 719 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.21 
 
 		 784 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  51.02 
 
 		 767 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  50.28 
 
 		 784 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  50.33 
 
 		 773 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 724 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.06 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  48.61 
 
 		 724 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  48.61 
 
 		 724 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.73 
 
 		 787 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  47.83 
 
 		 789 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  48.03 
 
 		 789 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  51.57 
 
 		 779 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  50.8 
 
 		 772 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 813 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  50.27 
 
 		 772 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  53.06 
 
 		 777 aa  673    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  50.35 
 
 		 718 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  50.76 
 
 		 802 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.47 
 
 		 722 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  53.63 
 
 		 719 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  51.12 
 
 		 821 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  49.47 
 
 		 765 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  50.6 
 
 		 774 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  51.53 
 
 		 773 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  71.26 
 
 		 759 aa  1054    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  50.73 
 
 		 774 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  82.79 
 
 		 757 aa  1248    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  52.1 
 
 		 740 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  48.47 
 
 		 722 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.5 
 
 		 787 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  50.13 
 
 		 790 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  51.72 
 
 		 775 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.34 
 
 		 722 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  49.73 
 
 		 799 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  50.07 
 
 		 773 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  50.97 
 
 		 772 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  49.41 
 
 		 782 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  49.73 
 
 		 766 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.38 
 
 		 781 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  50.61 
 
 		 799 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  48.99 
 
 		 798 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  50.6 
 
 		 804 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  48.05 
 
 		 778 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.67 
 
 		 776 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  49.67 
 
 		 787 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  50.33 
 
 		 814 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  50.26 
 
 		 815 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  52.06 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  47.35 
 
 		 775 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  50.82 
 
 		 772 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.84 
 
 		 754 aa  712    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  48.41 
 
 		 720 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  48.27 
 
 		 720 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  50.28 
 
 		 767 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.01 
 
 		 779 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 779 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.66 
 
 		 773 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.66 
 
 		 782 aa  683    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.14 
 
 		 790 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.86 
 
 		 774 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  51.44 
 
 		 779 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.77 
 
 		 774 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  51.32 
 
 		 774 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.95 
 
 		 713 aa  681    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  52 
 
 		 774 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.39 
 
 		 772 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  73.88 
 
 		 757 aa  1126    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  49.31 
 
 		 771 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.73 
 
 		 774 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.33 
 
 		 788 aa  718    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.83 
 
 		 787 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 779 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.97 
 
 		 798 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  74.9 
 
 		 723 aa  1090    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.8 
 
 		 770 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  51.66 
 
 		 778 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.06 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  47 
 
 		 728 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3200  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.91 
 
 		 785 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648133  normal  0.853857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.34 
 
 		 774 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.84 
 
 		 723 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  50.68 
 
 		 791 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.49 
 
 		 778 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>