More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0908 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.35 
 
 		 774 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  51.18 
 
 		 772 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  51.04 
 
 		 773 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  71.17 
 
 		 761 aa  1073    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.49 
 
 		 861 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.27 
 
 		 772 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  48.16 
 
 		 771 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.1 
 
 		 735 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  51.47 
 
 		 779 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.28 
 
 		 722 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  46.34 
 
 		 796 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.11 
 
 		 803 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  50.73 
 
 		 767 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  49.72 
 
 		 784 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  50.35 
 
 		 773 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.14 
 
 		 724 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 		 787 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  50.14 
 
 		 724 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  50 
 
 		 724 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  47.15 
 
 		 789 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  46.93 
 
 		 789 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.18 
 
 		 713 aa  669    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  50.77 
 
 		 772 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  72.56 
 
 		 757 aa  1098    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  50.07 
 
 		 772 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  52.3 
 
 		 777 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  50.46 
 
 		 802 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  50.98 
 
 		 719 aa  700    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  53.81 
 
 		 719 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  51.99 
 
 		 821 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  50.61 
 
 		 765 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.53 
 
 		 774 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  49.93 
 
 		 773 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  100 
 
 		 759 aa  1524    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  51.31 
 
 		 774 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  70.92 
 
 		 757 aa  1082    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  51.84 
 
 		 740 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 722 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.91 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.78 
 
 		 787 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  50 
 
 		 790 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  52.05 
 
 		 775 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.64 
 
 		 722 aa  661    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  47.98 
 
 		 799 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2483  RNA binding S1  49.27 
 
 		 807 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  49.59 
 
 		 793 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  51.04 
 
 		 772 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  50.2 
 
 		 782 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  49.61 
 
 		 803 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.98 
 
 		 781 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  48.79 
 
 		 799 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  48.25 
 
 		 798 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  50.07 
 
 		 804 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  49.13 
 
 		 778 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.26 
 
 		 813 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  50.26 
 
 		 787 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  51.32 
 
 		 814 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  51.31 
 
 		 815 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  51.91 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  46.44 
 
 		 775 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  51.23 
 
 		 772 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.48 
 
 		 754 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  48.81 
 
 		 720 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  49.09 
 
 		 720 aa  683    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  48.38 
 
 		 767 aa  681    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.2 
 
 		 779 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.06 
 
 		 779 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  51.99 
 
 		 774 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.97 
 
 		 782 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.46 
 
 		 790 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.66 
 
 		 787 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.73 
 
 		 774 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  50.63 
 
 		 779 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.59 
 
 		 784 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  50.35 
 
 		 718 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.8 
 
 		 773 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.7 
 
 		 774 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 776 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.99 
 
 		 773 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.31 
 
 		 774 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.78 
 
 		 788 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0686  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.47 
 
 		 768 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.93 
 
 		 779 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  70.18 
 
 		 723 aa  1028    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.53 
 
 		 770 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.53 
 
 		 798 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  50.07 
 
 		 778 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.87 
 
 		 798 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.91 
 
 		 777 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.18 
 
 		 713 aa  679    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3200  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.66 
 
 		 785 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648133  normal  0.853857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1042  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.87 
 
 		 794 aa  651    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.889463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.47 
 
 		 774 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.44 
 
 		 723 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.88 
 
 		 788 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>