More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1540 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.43 
 
 		 724 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  50.63 
 
 		 699 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 761 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  54.62 
 
 		 721 aa  728    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.52 
 
 		 716 aa  729    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  55.35 
 
 		 722 aa  775    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.1 
 
 		 716 aa  739    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  50.07 
 
 		 720 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  55.35 
 
 		 722 aa  776    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  55.35 
 
 		 724 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  55.35 
 
 		 724 aa  774    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  55.35 
 
 		 724 aa  774    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  63.87 
 
 		 718 aa  927    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  51.12 
 
 		 717 aa  736    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  55.35 
 
 		 724 aa  784    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  62.78 
 
 		 722 aa  913    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  49.86 
 
 		 727 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  49.01 
 
 		 754 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  54.77 
 
 		 728 aa  727    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.6 
 
 		 759 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  49.65 
 
 		 757 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1423    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  55.21 
 
 		 722 aa  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  48.66 
 
 		 762 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  48.96 
 
 		 718 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  55.21 
 
 		 722 aa  781    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  55.35 
 
 		 722 aa  773    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  57.78 
 
 		 721 aa  849    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  58.28 
 
 		 722 aa  824    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  48.8 
 
 		 719 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  59.41 
 
 		 720 aa  852    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  59.41 
 
 		 720 aa  847    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  48.8 
 
 		 719 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  80.11 
 
 		 722 aa  1128    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  96.07 
 
 		 713 aa  1373    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  50.91 
 
 		 713 aa  682    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  48.17 
 
 		 730 aa  658    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  50.14 
 
 		 710 aa  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.02 
 
 		 757 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 722 aa  774    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  55.25 
 
 		 718 aa  772    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.77 
 
 		 706 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  62.01 
 
 		 712 aa  872    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.66 
 
 		 723 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.1 
 
 		 716 aa  739    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  95.93 
 
 		 713 aa  1338    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.03 
 
 		 726 aa  651    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  60.53 
 
 		 718 aa  870    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  48.96 
 
 		 721 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.63 
 
 		 722 aa  781    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.6 
 
 		 720 aa  658    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  48.7 
 
 		 762 aa  633  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  48.94 
 
 		 756 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.09 
 
 		 780 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  46.88 
 
 		 760 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 754 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  48.82 
 
 		 817 aa  621  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  45.12 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  44.95 
 
 		 782 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.99 
 
 		 787 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  47.5 
 
 		 705 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  44.63 
 
 		 782 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.95 
 
 		 781 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  44.55 
 
 		 787 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.28 
 
 		 767 aa  616  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  43.98 
 
 		 763 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  46.47 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  44.78 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  45.18 
 
 		 778 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  45.79 
 
 		 772 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  45.09 
 
 		 774 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  44.49 
 
 		 778 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  44.35 
 
 		 779 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  44.86 
 
 		 801 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  43.86 
 
 		 802 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  45.82 
 
 		 719 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  45.09 
 
 		 821 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  44.35 
 
 		 784 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.37 
 
 		 813 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  45.4 
 
 		 766 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  45.99 
 
 		 769 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  44.37 
 
 		 773 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  44.54 
 
 		 778 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  45.88 
 
 		 769 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.37 
 
 		 774 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.77 
 
 		 774 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.62 
 
 		 759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  44.81 
 
 		 775 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  44.32 
 
 		 777 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  45.79 
 
 		 814 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  44.77 
 
 		 777 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.35 
 
 		 790 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.54 
 
 		 777 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.99 
 
 		 787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.67 
 
 		 774 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>