More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1079 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0135  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  63.79 
 
 		 657 aa  865    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.65 
 
 		 712 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  45.37 
 
 		 720 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  58.89 
 
 		 703 aa  843    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  100 
 
 		 704 aa  1425    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  45.09 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  45.49 
 
 		 718 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.47 
 
 		 713 aa  618  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.89 
 
 		 722 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.47 
 
 		 713 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.33 
 
 		 713 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  45.14 
 
 		 718 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.51 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.51 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  46.15 
 
 		 721 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.34 
 
 		 722 aa  598  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  46.37 
 
 		 722 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.56 
 
 		 716 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  43.12 
 
 		 717 aa  578  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  43.72 
 
 		 722 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.68 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  44.19 
 
 		 718 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.48 
 
 		 722 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  43.9 
 
 		 722 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 722 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 724 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  43.4 
 
 		 724 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  43.4 
 
 		 724 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  43.4 
 
 		 722 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  43.4 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  43.26 
 
 		 722 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  43.99 
 
 		 728 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  42.64 
 
 		 727 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.26 
 
 		 724 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.28 
 
 		 720 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.22 
 
 		 761 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  44.46 
 
 		 721 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  41.49 
 
 		 762 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  42.16 
 
 		 757 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  42.51 
 
 		 705 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  43.18 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  43.22 
 
 		 699 aa  531  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.12 
 
 		 723 aa  532  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  41.24 
 
 		 760 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  42.94 
 
 		 759 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  42.52 
 
 		 754 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  41.97 
 
 		 762 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  41.61 
 
 		 719 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  41.61 
 
 		 719 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.67 
 
 		 757 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  42.42 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  38.1 
 
 		 773 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  41.45 
 
 		 718 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  40.03 
 
 		 773 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  40.91 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  38.24 
 
 		 766 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  40.92 
 
 		 713 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  39.64 
 
 		 730 aa  508  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.86 
 
 		 720 aa  505  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  40.93 
 
 		 775 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  42.18 
 
 		 713 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 827 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  37.83 
 
 		 791 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.19 
 
 		 726 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.45 
 
 		 706 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  38.93 
 
 		 802 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  39.71 
 
 		 763 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.89 
 
 		 787 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.44 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  39.69 
 
 		 707 aa  492  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.22 
 
 		 778 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  39.61 
 
 		 777 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.48 
 
 		 803 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  39.14 
 
 		 779 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  39.57 
 
 		 767 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  40.51 
 
 		 719 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  38.82 
 
 		 736 aa  492  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  38.6 
 
 		 790 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  40.81 
 
 		 801 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  39.55 
 
 		 788 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  37.84 
 
 		 787 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  38.57 
 
 		 775 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.05 
 
 		 788 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  38.37 
 
 		 773 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  38.74 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  40.36 
 
 		 719 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1042  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.18 
 
 		 794 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.889463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  39.71 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  39.77 
 
 		 772 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  37.97 
 
 		 778 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.18 
 
 		 784 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.28 
 
 		 802 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.88 
 
 		 774 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  40.08 
 
 		 720 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  38.23 
 
 		 772 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  39.69 
 
 		 788 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.38 
 
 		 790 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  39.53 
 
 		 770 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>