More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0356 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0135  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  56.6 
 
 		 657 aa  776    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  100 
 
 		 703 aa  1403    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  58.89 
 
 		 704 aa  843    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  46.45 
 
 		 718 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.13 
 
 		 712 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.76 
 
 		 722 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  42.96 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  42.82 
 
 		 720 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  45.66 
 
 		 718 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.99 
 
 		 722 aa  596  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  45.47 
 
 		 718 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  45.03 
 
 		 722 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.19 
 
 		 713 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  45.16 
 
 		 721 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.33 
 
 		 713 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.33 
 
 		 713 aa  588  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.28 
 
 		 716 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.28 
 
 		 716 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.54 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.51 
 
 		 722 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  44.49 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  44.13 
 
 		 722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.18 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  44.18 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  44.18 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  44.04 
 
 		 722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  44.12 
 
 		 722 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  44.18 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  41.12 
 
 		 716 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.68 
 
 		 722 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.37 
 
 		 724 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  44.48 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.71 
 
 		 720 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  41.54 
 
 		 727 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  45.02 
 
 		 721 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  43.59 
 
 		 728 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.02 
 
 		 761 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.87 
 
 		 759 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  42.4 
 
 		 757 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  42.39 
 
 		 730 aa  534  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.33 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.36 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  41.6 
 
 		 762 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  42.8 
 
 		 713 aa  526  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  43.9 
 
 		 756 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  42.28 
 
 		 754 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  39.66 
 
 		 707 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.05 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  41.46 
 
 		 705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  39.55 
 
 		 760 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  39.09 
 
 		 762 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  42.8 
 
 		 756 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  38.62 
 
 		 719 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  38.62 
 
 		 719 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  42.32 
 
 		 699 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  43.34 
 
 		 772 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  40.09 
 
 		 718 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  42.43 
 
 		 710 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.32 
 
 		 723 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  41.26 
 
 		 721 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.75 
 
 		 720 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  43.07 
 
 		 713 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 754 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  40.99 
 
 		 710 aa  503  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.53 
 
 		 757 aa  505  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  40.26 
 
 		 719 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  42.35 
 
 		 770 aa  499  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  41.3 
 
 		 719 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  42.92 
 
 		 773 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.84 
 
 		 772 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  40.88 
 
 		 770 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.92 
 
 		 773 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.05 
 
 		 774 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  38.9 
 
 		 766 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  42.51 
 
 		 790 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.79 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  40.86 
 
 		 814 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  39.62 
 
 		 775 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  39.36 
 
 		 773 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  40.66 
 
 		 763 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 861 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  40.25 
 
 		 773 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.97 
 
 		 784 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.02 
 
 		 774 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  39.39 
 
 		 772 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  40.57 
 
 		 804 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.69 
 
 		 774 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  40.54 
 
 		 778 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.91 
 
 		 788 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  40.51 
 
 		 817 aa  488  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.33 
 
 		 774 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  42.18 
 
 		 802 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  40.52 
 
 		 787 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  41.11 
 
 		 777 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  41.37 
 
 		 795 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  41.47 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  40.19 
 
 		 772 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  39.53 
 
 		 774 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.23 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  40.48 
 
 		 767 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>