More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0291 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.17 
 
 		 774 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 772 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 		 773 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.06 
 
 		 761 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 861 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  50.07 
 
 		 773 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  48.85 
 
 		 779 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  50.07 
 
 		 773 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  50.76 
 
 		 767 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.34 
 
 		 773 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.03 
 
 		 774 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  54.24 
 
 		 713 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  48.14 
 
 		 838 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  53.29 
 
 		 760 aa  751    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  46.93 
 
 		 778 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.38 
 
 		 773 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 773 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  49.93 
 
 		 802 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  47.54 
 
 		 719 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  49.09 
 
 		 765 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  51.1 
 
 		 773 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  54.21 
 
 		 759 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  55.3 
 
 		 705 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  53.38 
 
 		 757 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  60.11 
 
 		 740 aa  821    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 773 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  52.62 
 
 		 756 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  62.43 
 
 		 756 aa  813    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.06 
 
 		 787 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  49.23 
 
 		 772 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  49.42 
 
 		 707 aa  681    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 710 aa  1418    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  51.14 
 
 		 770 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.36 
 
 		 707 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  50.07 
 
 		 787 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  50 
 
 		 814 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  50.92 
 
 		 772 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  57.61 
 
 		 754 aa  805    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  50.07 
 
 		 773 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  49.59 
 
 		 795 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.77 
 
 		 767 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  50.14 
 
 		 784 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  48.68 
 
 		 773 aa  668    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.92 
 
 		 787 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 773 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  51.4 
 
 		 762 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.07 
 
 		 794 aa  736    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.06 
 
 		 776 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.58 
 
 		 757 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.17 
 
 		 772 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  47.78 
 
 		 787 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  48.98 
 
 		 788 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.98 
 
 		 777 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  59.42 
 
 		 788 aa  773    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  56.66 
 
 		 775 aa  787    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  52.2 
 
 		 754 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.97 
 
 		 723 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  50.21 
 
 		 773 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.35 
 
 		 759 aa  778    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.96 
 
 		 723 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.51 
 
 		 774 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  48.42 
 
 		 718 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  50.28 
 
 		 773 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  47.54 
 
 		 719 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 766 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  49.86 
 
 		 763 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.5 
 
 		 787 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  49.09 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.36 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 802 aa  635  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.08 
 
 		 735 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  50.7 
 
 		 769 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  50 
 
 		 795 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  50.35 
 
 		 775 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.53 
 
 		 774 aa  632  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  51.59 
 
 		 801 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  47.77 
 
 		 799 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  50.5 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  48.14 
 
 		 719 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  50.5 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  50.5 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 		 777 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  47.66 
 
 		 777 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  46.59 
 
 		 775 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  50.5 
 
 		 776 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  47.6 
 
 		 719 aa  628  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.86 
 
 		 777 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  49.72 
 
 		 786 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  45.72 
 
 		 796 aa  625  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  48.59 
 
 		 779 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.14 
 
 		 769 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  47.66 
 
 		 777 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.57 
 
 		 803 aa  625  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.84 
 
 		 780 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.96 
 
 		 772 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.71 
 
 		 781 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 		 770 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  47.5 
 
 		 778 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.26 
 
 		 774 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  46.51 
 
 		 788 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>