More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0163 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.04 
 
 		 773 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  49.79 
 
 		 774 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  47.91 
 
 		 772 aa  658    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  47.91 
 
 		 773 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  47.23 
 
 		 791 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.62 
 
 		 761 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.3 
 
 		 861 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.09 
 
 		 803 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.23 
 
 		 774 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.18 
 
 		 735 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  48.3 
 
 		 779 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.37 
 
 		 813 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  45.57 
 
 		 796 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.24 
 
 		 784 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  51.46 
 
 		 762 aa  714    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  46.25 
 
 		 784 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  49.04 
 
 		 773 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.65 
 
 		 780 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  48.04 
 
 		 773 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.32 
 
 		 777 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  49.79 
 
 		 774 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1703  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.46 
 
 		 797 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247477  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 759 aa  1536    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  49.79 
 
 		 774 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  48.57 
 
 		 772 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.58 
 
 		 774 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  47.78 
 
 		 772 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  46.61 
 
 		 777 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.72 
 
 		 774 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  47.54 
 
 		 802 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.96 
 
 		 804 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  50.85 
 
 		 719 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  49.79 
 
 		 821 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  49.09 
 
 		 765 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  47.39 
 
 		 774 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.92 
 
 		 791 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  52.59 
 
 		 759 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  49.37 
 
 		 774 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  54.35 
 
 		 757 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  58.77 
 
 		 740 aa  816    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  46.24 
 
 		 786 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.53 
 
 		 803 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  47.84 
 
 		 790 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  48.46 
 
 		 775 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  48.02 
 
 		 773 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  46.99 
 
 		 799 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.46 
 
 		 773 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  48.17 
 
 		 772 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  47.59 
 
 		 782 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.57 
 
 		 787 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 781 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  46.43 
 
 		 799 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  47.05 
 
 		 798 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  47.95 
 
 		 804 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  47.48 
 
 		 778 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.42 
 
 		 707 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.45 
 
 		 787 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 812 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  48.58 
 
 		 814 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  49.65 
 
 		 815 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  48.79 
 
 		 779 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  45.08 
 
 		 775 aa  661    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.03 
 
 		 802 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  62.27 
 
 		 754 aa  896    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.18 
 
 		 815 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.87 
 
 		 794 aa  803    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  46.34 
 
 		 767 aa  652    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.13 
 
 		 779 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.75 
 
 		 779 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.7 
 
 		 787 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.54 
 
 		 772 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.25 
 
 		 790 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.37 
 
 		 774 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  48.51 
 
 		 779 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.6 
 
 		 813 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.51 
 
 		 776 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.83 
 
 		 787 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6672  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.44 
 
 		 901 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.98 
 
 		 787 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.65 
 
 		 774 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.93 
 
 		 788 aa  884    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  49.04 
 
 		 782 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.26 
 
 		 779 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.91 
 
 		 723 aa  727    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.45 
 
 		 776 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  47.97 
 
 		 778 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  48.04 
 
 		 773 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  48.04 
 
 		 773 aa  661    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.97 
 
 		 766 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  46.54 
 
 		 772 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.25 
 
 		 774 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.33 
 
 		 723 aa  790    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  48.04 
 
 		 773 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.23 
 
 		 777 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.3 
 
 		 774 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  49.79 
 
 		 774 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.41 
 
 		 757 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  49.79 
 
 		 774 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  49.09 
 
 		 719 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  46.92 
 
 		 791 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>