More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1085 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  48.94 
 
 		 779 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  50.98 
 
 		 772 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  50.98 
 
 		 773 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.19 
 
 		 761 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 861 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  48.76 
 
 		 795 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 777 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  48.75 
 
 		 772 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  49.03 
 
 		 779 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.72 
 
 		 722 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.95 
 
 		 787 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  48.4 
 
 		 766 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.65 
 
 		 722 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  49.58 
 
 		 767 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  49.72 
 
 		 784 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.95 
 
 		 773 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.44 
 
 		 724 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.96 
 
 		 772 aa  652    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  49.44 
 
 		 724 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  49.93 
 
 		 722 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  49.3 
 
 		 724 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  50.84 
 
 		 773 aa  658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  49.37 
 
 		 719 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  49.09 
 
 		 782 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  50.98 
 
 		 773 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.42 
 
 		 787 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  49.23 
 
 		 772 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  54.16 
 
 		 756 aa  725    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  49.17 
 
 		 772 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  50.7 
 
 		 776 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  50.98 
 
 		 773 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  48.55 
 
 		 802 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.9 
 
 		 759 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  50.7 
 
 		 719 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  50.7 
 
 		 776 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  48.46 
 
 		 765 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  49.09 
 
 		 774 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  47.78 
 
 		 778 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  52.27 
 
 		 759 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 722 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  52.97 
 
 		 757 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  54.99 
 
 		 740 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  48.81 
 
 		 787 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  49.51 
 
 		 722 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.09 
 
 		 774 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  51.12 
 
 		 773 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.26 
 
 		 780 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.9 
 
 		 757 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  49.58 
 
 		 724 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.58 
 
 		 802 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  50.28 
 
 		 791 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  49.93 
 
 		 772 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  49.44 
 
 		 722 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.77 
 
 		 804 aa  678    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 781 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  49.31 
 
 		 799 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.81 
 
 		 787 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  52.68 
 
 		 762 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.98 
 
 		 773 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.4 
 
 		 776 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.19 
 
 		 787 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  50.14 
 
 		 814 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  50.7 
 
 		 776 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.58 
 
 		 803 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  48.75 
 
 		 775 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  49.65 
 
 		 772 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  61.07 
 
 		 754 aa  854    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  47.76 
 
 		 720 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  47.76 
 
 		 720 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  49.72 
 
 		 767 aa  658    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 779 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.42 
 
 		 779 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  48.52 
 
 		 719 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  50.7 
 
 		 776 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 790 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  50.98 
 
 		 773 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  51.63 
 
 		 754 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.79 
 
 		 774 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.57 
 
 		 707 aa  766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.68 
 
 		 813 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  50.07 
 
 		 773 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  50.28 
 
 		 791 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.71 
 
 		 794 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.22 
 
 		 788 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.75 
 
 		 773 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.14 
 
 		 779 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.95 
 
 		 787 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.47 
 
 		 723 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  48.82 
 
 		 777 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.39 
 
 		 774 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  50.98 
 
 		 778 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0686  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.15 
 
 		 768 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  48.39 
 
 		 788 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.35 
 
 		 780 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.9 
 
 		 774 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.38 
 
 		 723 aa  763    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 791 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.95 
 
 		 774 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  49.17 
 
 		 786 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  49.16 
 
 		 718 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>