More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0669 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  52.58 
 
 		 762 aa  686    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  49.31 
 
 		 772 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  49.31 
 
 		 773 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.85 
 
 		 761 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  48.29 
 
 		 780 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  49.31 
 
 		 773 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  49.03 
 
 		 766 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.04 
 
 		 802 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  48.43 
 
 		 773 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.72 
 
 		 777 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.85 
 
 		 784 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  49.51 
 
 		 719 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  49.38 
 
 		 784 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.34 
 
 		 773 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  49.31 
 
 		 773 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  49.31 
 
 		 773 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.08 
 
 		 803 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  49.17 
 
 		 773 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.14 
 
 		 787 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  48.63 
 
 		 791 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.07 
 
 		 787 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  48.34 
 
 		 772 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.01 
 
 		 813 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  49.59 
 
 		 772 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  49.51 
 
 		 719 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  48.43 
 
 		 802 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.49 
 
 		 759 aa  776    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  50.76 
 
 		 719 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  49.52 
 
 		 821 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  49.31 
 
 		 773 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  47.91 
 
 		 778 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  52.9 
 
 		 759 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  49.17 
 
 		 770 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  52.63 
 
 		 757 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  57.06 
 
 		 740 aa  768    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.04 
 
 		 804 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  65.68 
 
 		 705 aa  924    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  49.04 
 
 		 773 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  53 
 
 		 757 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  54.24 
 
 		 707 aa  762    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.55 
 
 		 787 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  52.99 
 
 		 754 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  48.35 
 
 		 772 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  54.24 
 
 		 710 aa  729    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  50 
 
 		 777 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 781 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  48.48 
 
 		 799 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  48.97 
 
 		 775 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  47.32 
 
 		 778 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.24 
 
 		 774 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  48.83 
 
 		 787 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  49.17 
 
 		 814 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  50.49 
 
 		 718 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  47.16 
 
 		 775 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  60.68 
 
 		 754 aa  841    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  54.21 
 
 		 756 aa  724    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.38 
 
 		 767 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 779 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 779 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  59.77 
 
 		 775 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  51.81 
 
 		 763 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.86 
 
 		 790 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  49.17 
 
 		 773 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  52.82 
 
 		 756 aa  666    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  59.29 
 
 		 760 aa  844    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  48.41 
 
 		 787 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.31 
 
 		 773 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  49.45 
 
 		 777 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.84 
 
 		 780 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.53 
 
 		 788 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  49.79 
 
 		 784 aa  661    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.1 
 
 		 779 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.14 
 
 		 723 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  49.39 
 
 		 782 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  48.83 
 
 		 778 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.41 
 
 		 787 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  100 
 
 		 713 aa  1442    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.81 
 
 		 707 aa  745    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.97 
 
 		 774 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.71 
 
 		 723 aa  749    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  49.31 
 
 		 795 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  49.52 
 
 		 774 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1507  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.22 
 
 		 794 aa  754    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.78 
 
 		 774 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.63 
 
 		 791 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  47.43 
 
 		 774 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  48.35 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  49.39 
 
 		 775 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  47.98 
 
 		 719 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  48.63 
 
 		 791 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  46.95 
 
 		 777 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  48.35 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  48.35 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  47.96 
 
 		 777 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  48.35 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>