More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2413 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  45.77 
 
 		 718 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.99 
 
 		 713 aa  636    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 736 aa  1489    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  48.07 
 
 		 722 aa  682    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.13 
 
 		 722 aa  631  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.63 
 
 		 712 aa  628  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  43.72 
 
 		 720 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  43.72 
 
 		 720 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  44.09 
 
 		 718 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.12 
 
 		 713 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.9 
 
 		 713 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  46.37 
 
 		 721 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.63 
 
 		 722 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.99 
 
 		 716 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.99 
 
 		 716 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.92 
 
 		 724 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.27 
 
 		 722 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.19 
 
 		 706 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.29 
 
 		 716 aa  612  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  44.08 
 
 		 724 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  44.08 
 
 		 722 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  44.09 
 
 		 722 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.35 
 
 		 722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 722 aa  602  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 724 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  43.8 
 
 		 724 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  43.8 
 
 		 724 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  46.11 
 
 		 717 aa  600  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  43.8 
 
 		 722 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  43.29 
 
 		 727 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  43.8 
 
 		 722 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  46.8 
 
 		 721 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  44.16 
 
 		 718 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  44.77 
 
 		 762 aa  594  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  44.26 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 		 728 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.46 
 
 		 720 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 726 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0995  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.23 
 
 		 723 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  43.07 
 
 		 705 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.88 
 
 		 754 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  42.88 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.55 
 
 		 759 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  43.05 
 
 		 763 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.6 
 
 		 761 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  42.31 
 
 		 718 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  43.01 
 
 		 817 aa  554  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.32 
 
 		 780 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  42.45 
 
 		 719 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  43.11 
 
 		 757 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  41.55 
 
 		 772 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  42.45 
 
 		 719 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  42.54 
 
 		 760 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.09 
 
 		 759 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.23 
 
 		 781 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  41.71 
 
 		 730 aa  549  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  41.96 
 
 		 782 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  43.48 
 
 		 762 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  43.13 
 
 		 821 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  41.84 
 
 		 713 aa  547  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  44.44 
 
 		 754 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.23 
 
 		 723 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  42.99 
 
 		 774 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  42.33 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  43.15 
 
 		 789 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  43.29 
 
 		 789 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  42.18 
 
 		 802 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  42.84 
 
 		 775 aa  545  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.99 
 
 		 815 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  41.73 
 
 		 773 aa  543  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.71 
 
 		 787 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  42.56 
 
 		 719 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  40.27 
 
 		 765 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  42.72 
 
 		 774 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  42.72 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  42.92 
 
 		 801 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  42.24 
 
 		 782 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  44.2 
 
 		 756 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  40.77 
 
 		 773 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  42.86 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  41.27 
 
 		 777 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 774 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.65 
 
 		 757 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.52 
 
 		 787 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.98 
 
 		 787 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  41.71 
 
 		 787 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  40.97 
 
 		 779 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  42.08 
 
 		 795 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  41.61 
 
 		 799 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.45 
 
 		 813 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.58 
 
 		 787 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.31 
 
 		 812 aa  538  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  39.67 
 
 		 775 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.45 
 
 		 774 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>