More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0135 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0135  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  100 
 
 		 657 aa  1331    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  63.79 
 
 		 704 aa  865    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  56.6 
 
 		 703 aa  776    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  43.79 
 
 		 718 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  44.92 
 
 		 720 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  45.51 
 
 		 720 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.39 
 
 		 713 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.07 
 
 		 722 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  44.12 
 
 		 722 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.09 
 
 		 713 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.24 
 
 		 712 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.1 
 
 		 713 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  43.72 
 
 		 718 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.11 
 
 		 716 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.11 
 
 		 716 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 716 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  44.28 
 
 		 718 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.99 
 
 		 722 aa  535  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  43.39 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.03 
 
 		 722 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.42 
 
 		 722 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.79 
 
 		 724 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  43.47 
 
 		 722 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.58 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  41.69 
 
 		 721 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  43.03 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  42.28 
 
 		 724 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  42.28 
 
 		 724 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  42.28 
 
 		 724 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  42.28 
 
 		 722 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  42.88 
 
 		 724 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  42.14 
 
 		 722 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  40.68 
 
 		 727 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  41.97 
 
 		 762 aa  514  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.73 
 
 		 720 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  42.71 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  42.22 
 
 		 728 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  41.31 
 
 		 760 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  40.15 
 
 		 773 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.41 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  41.56 
 
 		 721 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  40.41 
 
 		 730 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  41.58 
 
 		 710 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  40.29 
 
 		 773 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  41.54 
 
 		 707 aa  485  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  42.75 
 
 		 699 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.32 
 
 		 706 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  40.65 
 
 		 761 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  39.74 
 
 		 773 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  39.74 
 
 		 766 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  41.95 
 
 		 713 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  40.96 
 
 		 719 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.15 
 
 		 774 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  40.96 
 
 		 719 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.6 
 
 		 707 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  39.68 
 
 		 779 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  39.5 
 
 		 772 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  39.8 
 
 		 802 aa  475  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  40.03 
 
 		 718 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  39.47 
 
 		 772 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  39.39 
 
 		 787 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  40.26 
 
 		 777 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.67 
 
 		 723 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  39.41 
 
 		 778 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  40 
 
 		 772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 774 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 787 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.44 
 
 		 790 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  40.79 
 
 		 713 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  39.1 
 
 		 777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.35 
 
 		 861 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf783  transcription accessory protein Tex  39.41 
 
 		 717 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  39.35 
 
 		 774 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.18 
 
 		 777 aa  469  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 774 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  39.76 
 
 		 779 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  38.81 
 
 		 788 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 780 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  38.59 
 
 		 756 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  39.49 
 
 		 705 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  39.44 
 
 		 777 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  40.5 
 
 		 767 aa  465  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  40.41 
 
 		 762 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  40.81 
 
 		 719 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  40 
 
 		 759 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  40.03 
 
 		 757 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.62 
 
 		 787 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  39.08 
 
 		 763 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.47 
 
 		 787 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  40.47 
 
 		 787 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  40.61 
 
 		 775 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  38.88 
 
 		 773 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  39.21 
 
 		 773 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 787 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  39.41 
 
 		 765 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.43 
 
 		 728 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  39.06 
 
 		 773 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.77 
 
 		 776 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.91 
 
 		 754 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.33 
 
 		 802 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>