More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0286 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.31 
 
 		 713 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.07 
 
 		 716 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.98 
 
 		 722 aa  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  51.46 
 
 		 720 aa  674    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.28 
 
 		 722 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  53.69 
 
 		 724 aa  768    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  53.69 
 
 		 724 aa  768    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  53.55 
 
 		 724 aa  768    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.46 
 
 		 724 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  53.56 
 
 		 722 aa  778    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 726 aa  1487    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  54.27 
 
 		 722 aa  788    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  53.55 
 
 		 722 aa  766    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  53.48 
 
 		 724 aa  775    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  49.3 
 
 		 718 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.07 
 
 		 716 aa  730    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  49.43 
 
 		 718 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.99 
 
 		 722 aa  769    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.79 
 
 		 712 aa  671    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  52.77 
 
 		 721 aa  707    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  48.82 
 
 		 720 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  48.96 
 
 		 720 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.07 
 
 		 716 aa  730    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  53.69 
 
 		 722 aa  768    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  50.63 
 
 		 721 aa  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  52.52 
 
 		 713 aa  710    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  57.16 
 
 		 730 aa  812    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  51.18 
 
 		 710 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  48.88 
 
 		 718 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.15 
 
 		 722 aa  637    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  48.97 
 
 		 722 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.03 
 
 		 713 aa  643    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.13 
 
 		 722 aa  791    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.44 
 
 		 713 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  52.22 
 
 		 728 aa  704    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  48.34 
 
 		 762 aa  634  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 761 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  48.03 
 
 		 717 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  46.95 
 
 		 718 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.63 
 
 		 706 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  46.6 
 
 		 719 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  46.6 
 
 		 719 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  46.69 
 
 		 757 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  46.03 
 
 		 777 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  44.65 
 
 		 779 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.87 
 
 		 774 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  45.89 
 
 		 788 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.04 
 
 		 784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  44.49 
 
 		 763 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  44.57 
 
 		 773 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  45.81 
 
 		 798 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  44.17 
 
 		 787 aa  602  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.33 
 
 		 723 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  47.66 
 
 		 754 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  43.58 
 
 		 802 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  45.62 
 
 		 719 aa  598  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  45.87 
 
 		 799 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.1 
 
 		 767 aa  595  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 861 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.45 
 
 		 774 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  45.7 
 
 		 777 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  45.22 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  45.38 
 
 		 765 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  45.17 
 
 		 774 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  45.22 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  44.44 
 
 		 727 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 773 aa  595  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  46.79 
 
 		 772 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  45.22 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  45.22 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  44.58 
 
 		 766 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.45 
 
 		 774 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  45.36 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 780 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.49 
 
 		 774 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  45.7 
 
 		 705 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  45.13 
 
 		 773 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  46.01 
 
 		 772 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  45.22 
 
 		 773 aa  592  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  44.91 
 
 		 773 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  44.96 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  45.67 
 
 		 772 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  45.19 
 
 		 777 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  45.58 
 
 		 821 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.69 
 
 		 757 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  44.43 
 
 		 782 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  44.58 
 
 		 799 aa  592  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  45.08 
 
 		 773 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  45.84 
 
 		 777 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  45.63 
 
 		 762 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  45.57 
 
 		 774 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  44.94 
 
 		 760 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  46.56 
 
 		 804 aa  588  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  47.52 
 
 		 756 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  45.08 
 
 		 776 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>