More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1388 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 721 aa  1456    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.88 
 
 		 761 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  59.5 
 
 		 718 aa  870    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.83 
 
 		 780 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  52.05 
 
 		 716 aa  741    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  57.49 
 
 		 722 aa  798    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  48.32 
 
 		 718 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  58.76 
 
 		 718 aa  838    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  58.33 
 
 		 728 aa  775    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.96 
 
 		 773 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  57.63 
 
 		 724 aa  801    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  57.63 
 
 		 724 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  57.49 
 
 		 724 aa  801    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.02 
 
 		 713 aa  834    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.55 
 
 		 782 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.24 
 
 		 724 aa  803    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  50.9 
 
 		 727 aa  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  59.58 
 
 		 722 aa  865    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  48.69 
 
 		 772 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.63 
 
 		 726 aa  690    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  57.63 
 
 		 724 aa  810    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  49.1 
 
 		 821 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  47.44 
 
 		 765 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  58.45 
 
 		 721 aa  782    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  48.39 
 
 		 784 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  49.23 
 
 		 757 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  57.49 
 
 		 722 aa  799    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.53 
 
 		 716 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  49.24 
 
 		 721 aa  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  46.99 
 
 		 773 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  48.4 
 
 		 719 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.05 
 
 		 722 aa  814    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  46.8 
 
 		 762 aa  636    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.72 
 
 		 720 aa  660    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.55 
 
 		 781 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.36 
 
 		 713 aa  836    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  48.68 
 
 		 773 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 722 aa  807    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.93 
 
 		 706 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  46.75 
 
 		 773 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  47.03 
 
 		 766 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  57.63 
 
 		 722 aa  801    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  54.1 
 
 		 720 aa  782    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  54.24 
 
 		 720 aa  783    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.2 
 
 		 713 aa  852    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  49.58 
 
 		 713 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  48.96 
 
 		 730 aa  683    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  49.72 
 
 		 710 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  53.94 
 
 		 717 aa  737    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  58.24 
 
 		 718 aa  842    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.19 
 
 		 723 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.68 
 
 		 722 aa  800    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.05 
 
 		 722 aa  804    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.53 
 
 		 716 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  58.33 
 
 		 722 aa  816    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  58.06 
 
 		 722 aa  806    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  48.4 
 
 		 719 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.33 
 
 		 712 aa  826    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  49.24 
 
 		 774 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  47.71 
 
 		 795 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  47.58 
 
 		 802 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.33 
 
 		 774 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  46.81 
 
 		 775 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.7 
 
 		 754 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  48.83 
 
 		 779 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  48.7 
 
 		 779 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  48.9 
 
 		 770 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  50 
 
 		 757 aa  635  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.15 
 
 		 774 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  47.36 
 
 		 699 aa  629  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.4 
 
 		 774 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  48.61 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  46.88 
 
 		 777 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.73 
 
 		 759 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  47.6 
 
 		 776 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  48.97 
 
 		 775 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  47.6 
 
 		 776 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.16 
 
 		 787 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  47.6 
 
 		 776 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.12 
 
 		 774 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.54 
 
 		 774 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  47.6 
 
 		 776 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.86 
 
 		 774 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.26 
 
 		 861 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  47.53 
 
 		 779 aa  628  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  47.11 
 
 		 772 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  47.99 
 
 		 777 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  47.82 
 
 		 762 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.98 
 
 		 813 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  48.71 
 
 		 815 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.38 
 
 		 812 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.98 
 
 		 774 aa  628  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.71 
 
 		 774 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  47.43 
 
 		 788 aa  628  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  47.46 
 
 		 776 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>