More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1283 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  49.3 
 
 		 722 aa  672    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.71 
 
 		 722 aa  646    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  48.61 
 
 		 718 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.51 
 
 		 716 aa  684    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.17 
 
 		 713 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 722 aa  675    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  50.49 
 
 		 720 aa  663    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  48.7 
 
 		 722 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 724 aa  675    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  50 
 
 		 724 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  50 
 
 		 724 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.7 
 
 		 724 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.58 
 
 		 722 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  49.03 
 
 		 718 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  49.86 
 
 		 722 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.16 
 
 		 726 aa  812    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  49.11 
 
 		 728 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.49 
 
 		 722 aa  691    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.24 
 
 		 713 aa  651    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  48.28 
 
 		 718 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.49 
 
 		 722 aa  647    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.09 
 
 		 713 aa  656    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  49.72 
 
 		 724 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  47.65 
 
 		 720 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  47.92 
 
 		 720 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.31 
 
 		 712 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  48.96 
 
 		 721 aa  683    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  49.37 
 
 		 722 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  50.63 
 
 		 713 aa  684    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  100 
 
 		 730 aa  1495    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  49.51 
 
 		 710 aa  653    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  48.82 
 
 		 721 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  49.86 
 
 		 722 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.26 
 
 		 716 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.26 
 
 		 716 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  46.77 
 
 		 727 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  45.69 
 
 		 717 aa  605  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.09 
 
 		 706 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  45.98 
 
 		 719 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  45.98 
 
 		 719 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.08 
 
 		 761 aa  586  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  45.47 
 
 		 699 aa  586  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.03 
 
 		 723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  45.89 
 
 		 760 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  46.64 
 
 		 757 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  45.69 
 
 		 762 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  44.69 
 
 		 719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  44.38 
 
 		 713 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.4 
 
 		 720 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  44.37 
 
 		 787 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.5 
 
 		 757 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  45.43 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  44.16 
 
 		 763 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  44.14 
 
 		 802 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  45.5 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 		 781 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  44.34 
 
 		 718 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  43.56 
 
 		 782 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  43.37 
 
 		 705 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  43.18 
 
 		 773 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  43.76 
 
 		 710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.13 
 
 		 754 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.7 
 
 		 780 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  43.4 
 
 		 799 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  42.06 
 
 		 798 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  43.67 
 
 		 788 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  43.9 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  43.56 
 
 		 787 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  43.69 
 
 		 784 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  43.82 
 
 		 773 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  44.01 
 
 		 799 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  46.27 
 
 		 754 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.7 
 
 		 787 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  43.4 
 
 		 779 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.42 
 
 		 787 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  43.49 
 
 		 766 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.56 
 
 		 787 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  43.53 
 
 		 767 aa  553  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  43.39 
 
 		 777 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  46.39 
 
 		 756 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  41.64 
 
 		 707 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  43.04 
 
 		 719 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  43.35 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  43.86 
 
 		 821 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  43.01 
 
 		 765 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 		 775 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  44.09 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  43.9 
 
 		 762 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1838  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.72 
 
 		 788 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.225923  normal  0.149327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  43.06 
 
 		 775 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  44.12 
 
 		 817 aa  542  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  41.71 
 
 		 736 aa  542  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.49 
 
 		 813 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  44.16 
 
 		 814 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2288  RNA binding S1 domain protein  43.37 
 
 		 793 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000426967  hitchhiker  0.0053186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>