More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1181 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.33 
 
 		 713 aa  647    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.03 
 
 		 713 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.02 
 
 		 712 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.56 
 
 		 722 aa  650    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 720 aa  1445    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.3 
 
 		 716 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  45.72 
 
 		 721 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  47.47 
 
 		 720 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  47.8 
 
 		 720 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 		 722 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  47.24 
 
 		 718 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.33 
 
 		 713 aa  650    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.3 
 
 		 716 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  47.85 
 
 		 718 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 722 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  44.4 
 
 		 717 aa  625  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.48 
 
 		 716 aa  625  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  45.78 
 
 		 718 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.94 
 
 		 722 aa  625  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  46.09 
 
 		 727 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.83 
 
 		 761 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  47.55 
 
 		 760 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 722 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.29 
 
 		 724 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  44.43 
 
 		 722 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.75 
 
 		 723 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  44.21 
 
 		 724 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 724 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  44.63 
 
 		 724 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  44.49 
 
 		 724 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  45.92 
 
 		 757 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  44.32 
 
 		 722 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 722 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.53 
 
 		 722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  44.63 
 
 		 722 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0274  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.16 
 
 		 662 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  44.09 
 
 		 759 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  46.67 
 
 		 728 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  47.48 
 
 		 721 aa  598  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  44.81 
 
 		 762 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  45.69 
 
 		 707 aa  593  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  45.83 
 
 		 721 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.05 
 
 		 754 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.81 
 
 		 757 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.14 
 
 		 726 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  45.66 
 
 		 817 aa  580  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  45.72 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  44.29 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  45.96 
 
 		 705 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  46.49 
 
 		 762 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  44.09 
 
 		 756 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  45.7 
 
 		 718 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  44.4 
 
 		 730 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  43.46 
 
 		 736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  43.95 
 
 		 754 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  42.44 
 
 		 710 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.64 
 
 		 786 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  45.4 
 
 		 720 aa  569  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  42.99 
 
 		 772 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  42.37 
 
 		 765 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  41.32 
 
 		 773 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  42.78 
 
 		 767 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.41 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.16 
 
 		 778 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  43.21 
 
 		 763 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  41.41 
 
 		 766 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  40.77 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.61 
 
 		 774 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  45.42 
 
 		 719 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  45.42 
 
 		 719 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.06 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  43.28 
 
 		 719 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.74 
 
 		 773 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  40.52 
 
 		 775 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  42.14 
 
 		 772 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  42.06 
 
 		 777 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  40.74 
 
 		 773 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  41.72 
 
 		 785 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 804 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  42.14 
 
 		 773 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  42.14 
 
 		 773 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  41.84 
 
 		 787 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.14 
 
 		 773 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  40.71 
 
 		 703 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  42.14 
 
 		 773 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  42.14 
 
 		 773 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.27 
 
 		 788 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  42.14 
 
 		 773 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  42.01 
 
 		 773 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  41.9 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  42.14 
 
 		 773 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.14 
 
 		 784 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  40.5 
 
 		 803 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  41.51 
 
 		 780 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 774 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  41.9 
 
 		 775 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  42.06 
 
 		 788 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  40.38 
 
 		 767 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  43.75 
 
 		 719 aa  548  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>