More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0767 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.58 
 
 		 774 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.44 
 
 		 787 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 772 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  50.07 
 
 		 773 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 861 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  50.43 
 
 		 791 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.99 
 
 		 735 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  46.99 
 
 		 779 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.36 
 
 		 774 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  47.16 
 
 		 838 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  47.87 
 
 		 784 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  47.99 
 
 		 773 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  47.15 
 
 		 773 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  48.68 
 
 		 773 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  47.44 
 
 		 787 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  46.88 
 
 		 788 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  48.27 
 
 		 772 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  47.19 
 
 		 779 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.05 
 
 		 804 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  48.06 
 
 		 777 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.42 
 
 		 774 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  46.73 
 
 		 802 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  48.68 
 
 		 775 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.54 
 
 		 777 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  48.68 
 
 		 821 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  50.07 
 
 		 765 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.75 
 
 		 774 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.07 
 
 		 803 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.37 
 
 		 787 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  49.57 
 
 		 776 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.57 
 
 		 791 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  49.57 
 
 		 776 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.89 
 
 		 774 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.56 
 
 		 784 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  49.93 
 
 		 773 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.21 
 
 		 773 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.15 
 
 		 786 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.71 
 
 		 772 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  47.66 
 
 		 782 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  50.07 
 
 		 773 aa  671    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.68 
 
 		 781 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  47.37 
 
 		 799 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  49.38 
 
 		 780 aa  672    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  47.5 
 
 		 804 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  47.94 
 
 		 795 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  50.57 
 
 		 791 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.6 
 
 		 787 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  49.57 
 
 		 776 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  48.79 
 
 		 795 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.26 
 
 		 780 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  46.51 
 
 		 775 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  47.76 
 
 		 784 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  46.76 
 
 		 777 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  44.86 
 
 		 720 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  44.58 
 
 		 720 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  49.17 
 
 		 767 aa  668    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.99 
 
 		 779 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 779 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.96 
 
 		 787 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.69 
 
 		 790 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.08 
 
 		 772 aa  636    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.54 
 
 		 782 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  47.19 
 
 		 779 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.52 
 
 		 813 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.71 
 
 		 776 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  50.07 
 
 		 773 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  49.57 
 
 		 776 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  49.57 
 
 		 776 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 720 aa  1467    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.22 
 
 		 773 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 779 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  48.93 
 
 		 778 aa  684    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  47.34 
 
 		 766 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  47.26 
 
 		 778 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.27 
 
 		 776 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.61 
 
 		 728 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 773 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.69 
 
 		 774 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  50.07 
 
 		 773 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  48.96 
 
 		 777 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  46.52 
 
 		 788 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  50.07 
 
 		 773 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  49.1 
 
 		 777 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.3 
 
 		 787 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.25 
 
 		 798 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  48.68 
 
 		 775 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  48.68 
 
 		 774 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  47.19 
 
 		 796 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  48.64 
 
 		 786 aa  635  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  47.09 
 
 		 772 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  48.51 
 
 		 790 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  46.75 
 
 		 770 aa  635  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  47.5 
 
 		 777 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.6 
 
 		 802 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.61 
 
 		 772 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>