26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2404 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  67.09 
 
 		 637 aa  808    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  67.36 
 
 		 634 aa  819    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  67.14 
 
 		 636 aa  818    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  65.19 
 
 		 641 aa  817    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 648 aa  1298    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  45.37 
 
 		 722 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  44.96 
 
 		 612 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  47.36 
 
 		 611 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  44.81 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  45.23 
 
 		 612 aa  525  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  41.92 
 
 		 710 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  43.91 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  42.95 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  37.38 
 
 		 761 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  36.92 
 
 		 761 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  37.22 
 
 		 761 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  37.62 
 
 		 761 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  35.83 
 
 		 758 aa  416  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.53 
 
 		 725 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34 
 
 		 735 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.52 
 
 		 731 aa  226  8e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.13 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.72 
 
 		 730 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  30.61 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  38.24 
 
 		 722 aa  44.3  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>