63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1359 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 
761 aa  1554    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  95.53 
 
 
761 aa  1476    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  70.22 
 
 
758 aa  1128    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  81.55 
 
 
761 aa  1308    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  96.06 
 
 
761 aa  1503    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  42.99 
 
 
707 aa  597  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  41.57 
 
 
710 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  39.31 
 
 
722 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  40.82 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  41.23 
 
 
611 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  39.21 
 
 
612 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  38.35 
 
 
612 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  38.63 
 
 
612 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  40.06 
 
 
636 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  36.92 
 
 
648 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  36.83 
 
 
637 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  36.45 
 
 
641 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  36.51 
 
 
634 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.78 
 
 
735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.06 
 
 
725 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.44 
 
 
732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.77 
 
 
731 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.7 
 
 
730 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2486  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
688 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.172439  normal  0.868366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.25 
 
 
377 aa  52.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  36.59 
 
 
377 aa  51.2  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  35.37 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  35.37 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02040  DNAj protein, putative  36.25 
 
 
503 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  35.06 
 
 
378 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  32.47 
 
 
373 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.46 
 
 
708 aa  48.5  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  28.7 
 
 
124 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2085  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.44 
 
 
525 aa  48.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0350737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 
723 aa  47.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  36.99 
 
 
121 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2561  DnaJ central domain protein  26.28 
 
 
519 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00796281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  32.91 
 
 
378 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.29 
 
 
717 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.88 
 
 
710 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.14 
 
 
693 aa  47  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  33.75 
 
 
375 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  29.2 
 
 
629 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 
712 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  30.77 
 
 
792 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.11 
 
 
718 aa  45.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1720  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
632 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  32.91 
 
 
376 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1356  chaperone protein DnaJ  28 
 
 
378 aa  45.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  31.25 
 
 
511 aa  45.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  30.69 
 
 
686 aa  44.3  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  31.25 
 
 
385 aa  44.3  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 
712 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  29.06 
 
 
720 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  26.49 
 
 
296 aa  44.3  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>