31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1907 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  66.4 
 
 		 634 aa  809    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  67.14 
 
 		 648 aa  827    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  68.28 
 
 		 641 aa  860    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  66.61 
 
 		 637 aa  811    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 636 aa  1271    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  47.6 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  50 
 
 		 611 aa  571  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  46.89 
 
 		 611 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  47.29 
 
 		 612 aa  557  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  44.88 
 
 		 612 aa  555  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  46.22 
 
 		 707 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  44.97 
 
 		 722 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  42.95 
 
 		 710 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  40.69 
 
 		 761 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  40.54 
 
 		 761 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  40.06 
 
 		 761 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  38.64 
 
 		 758 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  39.59 
 
 		 761 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.98 
 
 		 735 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.06 
 
 		 725 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.14 
 
 		 732 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.2 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.3 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.07 
 
 		 702 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  38.03 
 
 		 722 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  40.62 
 
 		 121 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.57 
 
 		 733 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.88 
 
 		 708 aa  44.3  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.99 
 
 		 695 aa  43.9  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2316  RNA-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 740 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>