32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1586 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  55.04 
 
 		 710 aa  676    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1249    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  72.98 
 
 		 612 aa  919    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  69.36 
 
 		 611 aa  846    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  65.02 
 
 		 612 aa  827    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  57.43 
 
 		 722 aa  707    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  56.36 
 
 		 707 aa  699    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  65.02 
 
 		 612 aa  814    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  46.89 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  43.91 
 
 		 648 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  44.66 
 
 		 641 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  44.3 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  43.86 
 
 		 634 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  43.44 
 
 		 758 aa  488  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  40.22 
 
 		 761 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  41.34 
 
 		 761 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  40.44 
 
 		 761 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  39.65 
 
 		 761 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.49 
 
 		 725 aa  257  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.08 
 
 		 735 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.62 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.93 
 
 		 732 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.43 
 
 		 730 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 703 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  25.66 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0970  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.56 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  30.59 
 
 		 720 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 702 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.21 
 
 		 718 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  27.83 
 
 		 140 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 702 aa  44.3  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  24.78 
 
 		 467 aa  43.9  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>