24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2119 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  88.54 
 
 		 637 aa  1101    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 634 aa  1269    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  66.4 
 
 		 636 aa  807    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  64.72 
 
 		 641 aa  817    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  67.36 
 
 		 648 aa  830    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  46.99 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  45.86 
 
 		 612 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  45.38 
 
 		 612 aa  554  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  47.55 
 
 		 611 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  45.7 
 
 		 707 aa  545  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  45.39 
 
 		 612 aa  535  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  43.86 
 
 		 611 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  42.43 
 
 		 710 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  36.73 
 
 		 761 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  38.09 
 
 		 761 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  36.36 
 
 		 761 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  36.42 
 
 		 761 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  36.15 
 
 		 758 aa  428  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.62 
 
 		 735 aa  278  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.02 
 
 		 725 aa  277  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.51 
 
 		 731 aa  253  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.66 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.64 
 
 		 730 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.93 
 
 		 733 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>