52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1616 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  53.93 
 
 		 731 aa  692    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  52.17 
 
 		 732 aa  681    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 725 aa  1407    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54 
 
 		 735 aa  709    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.6 
 
 		 730 aa  618  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  35.95 
 
 		 637 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  35.5 
 
 		 634 aa  267  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  32.88 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  31.99 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  32.28 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  33.66 
 
 		 636 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  33.14 
 
 		 611 aa  246  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.42 
 
 		 707 aa  241  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  31.92 
 
 		 722 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  33.64 
 
 		 648 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  30.35 
 
 		 612 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  33.86 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  29.12 
 
 		 761 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  28.94 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  28.21 
 
 		 761 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  29.17 
 
 		 612 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  27.99 
 
 		 761 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  27.86 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.78 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.78 
 
 		 721 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.78 
 
 		 721 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.88 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.35 
 
 		 696 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.37 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.88 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.73 
 
 		 722 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 703 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1167  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.14 
 
 		 698 aa  47.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.3 
 
 		 711 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.36 
 
 		 697 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.72 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1664  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.18 
 
 		 913 aa  45.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.36 
 
 		 697 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 701 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.67 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 489 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.19 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  34.92 
 
 		 598 aa  44.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1044  30S ribosomal protein S1  29.82 
 
 		 392 aa  44.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.53 
 
 		 702 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.14 
 
 		 736 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.53 
 
 		 702 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 702 aa  43.9  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.82 
 
 		 729 aa  43.9  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.82 
 
 		 729 aa  43.9  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>