29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1551 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  63.61 
 
 		 612 aa  825    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  70.87 
 
 		 612 aa  907    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  69.36 
 
 		 611 aa  866    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1241    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  64.69 
 
 		 612 aa  827    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  55.13 
 
 		 722 aa  698    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  55 
 
 		 710 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  56.17 
 
 		 707 aa  707    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  50 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  47.36 
 
 		 648 aa  556  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  47.55 
 
 		 634 aa  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  46.73 
 
 		 641 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  46.94 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  42.16 
 
 		 758 aa  491  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  40.66 
 
 		 761 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  40.82 
 
 		 761 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  40.79 
 
 		 761 aa  483  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  40.66 
 
 		 761 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.08 
 
 		 735 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.2 
 
 		 725 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.34 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.61 
 
 		 732 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.48 
 
 		 730 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.37 
 
 		 702 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 702 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 702 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 703 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.36 
 
 		 718 aa  43.9  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.8 
 
 		 706 aa  43.9  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>