More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2860 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  100 
 
 		 121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  61.16 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  57.41 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  54.13 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  43.24 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  42.34 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  42.11 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  41.18 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.67 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.67 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  50.56 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  39.64 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  37.61 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  51.76 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  49.43 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  49.43 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  50.63 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  38.74 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.11 
 
 		 712 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  49.37 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  49.37 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  49.37 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  49.37 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.05 
 
 		 514 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  48.28 
 
 		 686 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.05 
 
 		 503 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  47.44 
 
 		 405 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  47.44 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  47.95 
 
 		 584 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  47.95 
 
 		 584 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  45.68 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.84 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  49.33 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  48 
 
 		 493 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  47.44 
 
 		 403 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.78 
 
 		 736 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  43.82 
 
 		 705 aa  73.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.75 
 
 		 277 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  47.95 
 
 		 579 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  54.67 
 
 		 733 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  44.57 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  50.65 
 
 		 400 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 367 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  46.58 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  35.71 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  44.87 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  47.37 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 495 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  44 
 
 		 678 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  45.16 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  40.22 
 
 		 760 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  43.59 
 
 		 584 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.78 
 
 		 713 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  46.43 
 
 		 672 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  49.33 
 
 		 568 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  49.33 
 
 		 568 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  49.33 
 
 		 568 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  46.67 
 
 		 487 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  44.3 
 
 		 556 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.86 
 
 		 501 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.17 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  44.3 
 
 		 556 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  44.3 
 
 		 556 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.59 
 
 		 777 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  36.44 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  43.04 
 
 		 480 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  43.84 
 
 		 586 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  43.42 
 
 		 500 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  48.57 
 
 		 587 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 479 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 481 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  44.05 
 
 		 408 aa  70.1  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  38.82 
 
 		 756 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 479 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 481 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  38.82 
 
 		 754 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 479 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  46.05 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.62 
 
 		 746 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 757 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  44 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.3 
 
 		 755 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>