More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3006 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  61.16 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  55.14 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  54.63 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  54.63 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  53.7 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  50.91 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  42.11 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  37.93 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  42.2 
 
 		 584 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  42.2 
 
 		 584 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  46.59 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  55.41 
 
 		 515 aa  80.1  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  48.86 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.05 
 
 		 514 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  48.86 
 
 		 400 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.05 
 
 		 503 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  45.74 
 
 		 400 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  46.43 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  46.43 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  46.43 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  47.06 
 
 		 579 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  41.03 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.61 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  46.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  38.14 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 491 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 491 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  42.73 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  54.29 
 
 		 492 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  54.29 
 
 		 496 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  62.3 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.32 
 
 		 733 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  48.75 
 
 		 599 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  39.47 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  39.56 
 
 		 574 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  51.43 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  49.38 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  38.52 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  54.29 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  51.32 
 
 		 492 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  52.86 
 
 		 495 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  50 
 
 		 500 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  48 
 
 		 493 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  37.5 
 
 		 492 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  34.82 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  43.02 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  51.43 
 
 		 493 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  52.86 
 
 		 488 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  54.29 
 
 		 490 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  51.43 
 
 		 488 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  41.67 
 
 		 686 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  41.98 
 
 		 678 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  50 
 
 		 487 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  54.41 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  50 
 
 		 480 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  49.38 
 
 		 500 aa  75.5  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  38.33 
 
 		 499 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  48.65 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  54.41 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 584 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  52.86 
 
 		 481 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  49.38 
 
 		 491 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 568 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.57 
 
 		 736 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 568 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  40.43 
 
 		 756 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 568 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  48.65 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  43.59 
 
 		 557 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  51.43 
 
 		 490 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  46.15 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  43.21 
 
 		 367 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  43.43 
 
 		 557 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  51.43 
 
 		 487 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  49.35 
 
 		 720 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>