More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0058 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  86.18 
 
 
132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  67.55 
 
 
160 aa  183  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  67.11 
 
 
161 aa  183  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  67.11 
 
 
161 aa  183  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  66.45 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  68.53 
 
 
152 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  65.19 
 
 
133 aa  166  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  62.59 
 
 
133 aa  165  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  62.59 
 
 
133 aa  165  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  62.6 
 
 
130 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  58.78 
 
 
128 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  59.06 
 
 
124 aa  140  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.3 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  58.54 
 
 
134 aa  137  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  47.86 
 
 
144 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  51.09 
 
 
140 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  47.45 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  50.81 
 
 
120 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  57.36 
 
 
134 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000584856  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  47.01 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  47.01 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  45.52 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  46.92 
 
 
120 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000591466  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  40 
 
 
164 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  47.17 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  46.23 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  39.29 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.51 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.8 
 
 
124 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.8 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  38.58 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1166  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.39 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000391852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  38.74 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  40.71 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0861  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.16 
 
 
720 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  43.4 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  41.18 
 
 
720 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.62 
 
 
706 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  34.82 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.28 
 
 
705 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0168  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.77 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  38.84 
 
 
376 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.81 
 
 
706 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  45.98 
 
 
686 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.68 
 
 
772 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.38 
 
 
706 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
734 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.85 
 
 
711 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45 
 
 
702 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  51.85 
 
 
734 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.85 
 
 
711 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.43 
 
 
733 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0398  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.65 
 
 
732 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
711 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.91 
 
 
711 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  46.05 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.35 
 
 
705 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45 
 
 
699 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.7 
 
 
705 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0729  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.39 
 
 
695 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504772  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 
720 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
722 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  42.86 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01817  Polynucleotide phosphorylase  42.7 
 
 
353 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00061601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.95 
 
 
703 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  38.18 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
700 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000990055  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.19 
 
 
759 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.23 
 
 
736 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  46.15 
 
 
742 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.722392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000012543  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000390234  hitchhiker  0.0000000630128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 
698 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0159879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>