More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0142 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  64.93 
 
 
130 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  66.67 
 
 
126 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  56.25 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000591466  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  52.17 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  58.87 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  52.78 
 
 
144 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  50.71 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  61.42 
 
 
134 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000584856  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  48.03 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  56.91 
 
 
132 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  51.49 
 
 
134 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  51.49 
 
 
134 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  57.72 
 
 
132 aa  127  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  49.65 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  48.03 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  48.03 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  48.34 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  54.17 
 
 
120 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  49.62 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  53.6 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  45.14 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  49.04 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  50 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.08 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.34 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  47.37 
 
 
133 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  41.9 
 
 
376 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  43.86 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  43.86 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  43.86 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  58.11 
 
 
705 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  42.98 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  42.73 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1166  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.51 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.9 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.51 
 
 
712 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.9 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  43.81 
 
 
399 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
696 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 
696 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  45.35 
 
 
759 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.9 
 
 
722 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  42.05 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
715 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
714 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  44.32 
 
 
778 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
714 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.91 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.91 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  48.28 
 
 
574 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.19 
 
 
716 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2277  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.86 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000289568  normal  0.091907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.37 
 
 
706 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  42.42 
 
 
773 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.05 
 
 
772 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.86 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.51 
 
 
782 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2253  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.86 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.86 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  46.05 
 
 
772 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.3 
 
 
718 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.32 
 
 
861 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.79 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 
774 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  46.51 
 
 
385 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.19 
 
 
753 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.07 
 
 
706 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  36.44 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 
774 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
720 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0163  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.83 
 
 
759 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.95 
 
 
774 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.43 
 
 
766 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  43.48 
 
 
557 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  46.58 
 
 
773 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.59 
 
 
411 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>