More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0677 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  76.52 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  45.24 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  44.63 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  43.24 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  46.43 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  38.71 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  41.59 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  42.31 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  45.19 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  45.19 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  43.93 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  41 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  38.46 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  41.11 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  33.58 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  40.45 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  40.45 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 747 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.08 
 
 		 501 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  41.18 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.1 
 
 		 514 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 746 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  34.94 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.03 
 
 		 341 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  35.59 
 
 		 328 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 		 755 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 390 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  31.9 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  38.16 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  31.9 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  32.84 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.1 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  40.96 
 
 		 485 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  32.99 
 
 		 578 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1193  RNA binding S1 domain protein  41.1 
 
 		 500 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000667111  hitchhiker  0.00401101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  32.84 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  33.86 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  40 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  32.03 
 
 		 499 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  40 
 
 		 488 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.89 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.07 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.84 
 
 		 777 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  32.56 
 
 		 495 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  34.21 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  41.03 
 
 		 418 aa  61.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  37.35 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  40.85 
 
 		 492 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  33.02 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  35.29 
 
 		 427 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  40.58 
 
 		 493 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  38.36 
 
 		 557 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  40.58 
 
 		 493 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 		 331 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 481 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 		 331 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  39.74 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 481 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  33.78 
 
 		 562 aa  60.1  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 485 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 481 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  37.78 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  35.11 
 
 		 732 aa  60.1  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  41.33 
 
 		 495 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  39.74 
 
 		 500 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  36.84 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.77 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  39.74 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>