More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1211 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  67.61 
 
 
302 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  67.61 
 
 
302 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  52.46 
 
 
302 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  52.8 
 
 
304 aa  318  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.94 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  51.25 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  45.71 
 
 
292 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  42.32 
 
 
481 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  42.37 
 
 
408 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  40.21 
 
 
416 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  40.82 
 
 
465 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  40.82 
 
 
431 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  39.5 
 
 
331 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  39.5 
 
 
331 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 
328 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  39.15 
 
 
412 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  39.57 
 
 
401 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  39.21 
 
 
401 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.08 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  40.31 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  38.08 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  39.15 
 
 
424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  38.65 
 
 
367 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  37.72 
 
 
390 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  39.48 
 
 
284 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  39.93 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  37.37 
 
 
321 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  38.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  38.08 
 
 
363 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  38.08 
 
 
363 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  38.65 
 
 
386 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  37.94 
 
 
369 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  37.94 
 
 
369 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  37.72 
 
 
366 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  37.72 
 
 
363 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  37.59 
 
 
371 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  38.08 
 
 
339 aa  205  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  33.83 
 
 
491 aa  155  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 
481 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 
481 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  33.83 
 
 
500 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
479 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
479 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
479 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  31.95 
 
 
481 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  32.57 
 
 
427 aa  149  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
495 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  33.71 
 
 
403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  32.69 
 
 
529 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 
493 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  32.33 
 
 
487 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  33.71 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
485 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  32.71 
 
 
488 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 
490 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  31.95 
 
 
495 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  31.52 
 
 
418 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
491 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
491 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  32.12 
 
 
492 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  30.51 
 
 
416 aa  143  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  31.23 
 
 
485 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  32.16 
 
 
678 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.44 
 
 
654 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  31.58 
 
 
493 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  32.33 
 
 
490 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  31.95 
 
 
500 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  31.2 
 
 
492 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  32.33 
 
 
492 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  31.58 
 
 
487 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  31.44 
 
 
485 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 
505 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  31.95 
 
 
488 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  31.23 
 
 
515 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  31.44 
 
 
496 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  31.37 
 
 
499 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  31.82 
 
 
480 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  32.96 
 
 
705 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  31 
 
 
686 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  31.95 
 
 
496 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  31.95 
 
 
493 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  31.01 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.46 
 
 
736 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 
378 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.68 
 
 
677 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  27.94 
 
 
694 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  30.45 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.73 
 
 
661 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.47 
 
 
397 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.78 
 
 
676 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.39 
 
 
388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.08 
 
 
393 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  32.09 
 
 
619 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  31.07 
 
 
407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  30.53 
 
 
400 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.42 
 
 
672 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.04 
 
 
687 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.25 
 
 
672 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  29.32 
 
 
592 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>