More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2502 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  57.95 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.76 
 
 		 301 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  53.33 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  53.33 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  52.8 
 
 		 284 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  50.51 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  47.87 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  46.82 
 
 		 481 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  44.94 
 
 		 424 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  44.94 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  40.91 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  40.91 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  43.02 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  43.02 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  40.56 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  40.13 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.51 
 
 		 341 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  38.97 
 
 		 390 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  42.37 
 
 		 408 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  40.21 
 
 		 367 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  39.86 
 
 		 386 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  38.67 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 		 369 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  38.81 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  37.72 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  39.24 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  37.76 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  40.14 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  37.76 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  37.76 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  37.76 
 
 		 366 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  39.31 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  38.55 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  38.93 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  34.51 
 
 		 387 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.54 
 
 		 393 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  32.05 
 
 		 678 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.28 
 
 		 736 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  29.89 
 
 		 529 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.08 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  30.15 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  30.69 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  32.81 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  32.81 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 493 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  30.74 
 
 		 495 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  30.69 
 
 		 378 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  32.81 
 
 		 382 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  32.06 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  29.86 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  30.69 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.74 
 
 		 654 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  31.13 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  30.11 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  30 
 
 		 487 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 479 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 479 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 479 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 481 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  32.06 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 481 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  29.64 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  29.64 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  32.34 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.47 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 495 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.8 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.18 
 
 		 687 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  31.19 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  30.18 
 
 		 515 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  32.97 
 
 		 570 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  31.89 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  29.26 
 
 		 481 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  27.37 
 
 		 686 aa  119  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  30.4 
 
 		 499 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  31.5 
 
 		 566 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  33.59 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  29.26 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  30.16 
 
 		 493 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.68 
 
 		 672 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  30.16 
 
 		 492 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  28 
 
 		 480 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  28.28 
 
 		 485 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  28.28 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  29.46 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  28.73 
 
 		 490 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  31.88 
 
 		 558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  31.3 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>