More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0653 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
120 aa  235  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.62 
 
 
126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  54.62 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  54.17 
 
 
128 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  51.22 
 
 
130 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  56.36 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  53.78 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000591466  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  47.37 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  49.59 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  50.41 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  45.38 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  52.31 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  52.31 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  47.62 
 
 
133 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  45.45 
 
 
152 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  44.63 
 
 
134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  45.07 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  44.76 
 
 
161 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  44.76 
 
 
161 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  44.76 
 
 
161 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  40.56 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.17 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.17 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  52.94 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000584856  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  44.23 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1166  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.19 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000391852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  41.35 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  40 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.68 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  38.1 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  42.73 
 
 
399 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.61 
 
 
164 aa  76.6  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0168  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.98 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  47.89 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
712 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.89 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.89 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.67 
 
 
714 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.67 
 
 
714 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44 
 
 
696 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44 
 
 
696 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.17 
 
 
715 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.17 
 
 
713 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3218  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.65 
 
 
716 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.65 
 
 
718 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1024  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.29 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.547998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2277  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.29 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000289568  normal  0.091907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1641  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.29 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0365038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2253  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  54.29 
 
 
715 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1834  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1430  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0408  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1294  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0739218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1285  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1125  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0742  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.78 
 
 
713 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
706 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.1 
 
 
711 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  37.61 
 
 
376 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  53.62 
 
 
772 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  34.45 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3514  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.95 
 
 
772 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.15 
 
 
705 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.89 
 
 
694 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 
753 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
734 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
706 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.57 
 
 
706 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3260  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.7 
 
 
707 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 
720 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  51.28 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 
711 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 
698 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  46.84 
 
 
734 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
705 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.58 
 
 
771 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.39 
 
 
705 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.39 
 
 
705 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.39 
 
 
705 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0021  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.68 
 
 
303 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000787373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.87 
 
 
712 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1399  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 
751 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104449  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 
706 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2817  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 
757 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.83 
 
 
703 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0845346  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0923  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.28 
 
 
725 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>