More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0493 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
373 aa  757    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  63.1 
 
 
373 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
362 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  63.1 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  63.37 
 
 
374 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
376 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  55.65 
 
 
380 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  49.47 
 
 
373 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  51.49 
 
 
359 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
376 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  40.16 
 
 
376 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  40.16 
 
 
376 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
379 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
379 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
379 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
379 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
379 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
377 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
377 aa  269  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.93 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.04 
 
 
378 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  39.04 
 
 
379 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  39.04 
 
 
379 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  39.04 
 
 
379 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  38.77 
 
 
378 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
375 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  36.31 
 
 
368 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  37.13 
 
 
376 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  36.51 
 
 
374 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  36.04 
 
 
368 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  39.33 
 
 
378 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  39.46 
 
 
387 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  39.35 
 
 
389 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  35.97 
 
 
374 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0027  chaperone protein DnaJ  39.14 
 
 
374 aa  259  6e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0034  chaperone protein DnaJ  38.99 
 
 
378 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.953723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  36.51 
 
 
371 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
376 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
376 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
376 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
376 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  39.62 
 
 
379 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  37.23 
 
 
380 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
374 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  38.51 
 
 
372 aa  257  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
378 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
378 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
378 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
378 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
374 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
378 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
378 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
381 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
376 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
376 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  37.67 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  37.13 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  37.77 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  37.7 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  42.69 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  37.63 
 
 
365 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  37.33 
 
 
376 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  38.94 
 
 
374 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
370 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  38.65 
 
 
374 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  36.86 
 
 
376 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
375 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  36.93 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  39.36 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  37.67 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  38.17 
 
 
377 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  37.27 
 
 
372 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
378 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  36.1 
 
 
372 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
376 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.97 
 
 
381 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  36.8 
 
 
380 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  37.23 
 
 
376 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  38.99 
 
 
382 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 
377 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  38.62 
 
 
379 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  37.07 
 
 
375 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  37.57 
 
 
373 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  38.73 
 
 
382 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
381 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  35.95 
 
 
378 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  38.56 
 
 
376 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>