More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1286 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  100 
 
 
373 aa  772    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
376 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  55.47 
 
 
362 aa  401  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  53.1 
 
 
380 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  53.08 
 
 
373 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  52.28 
 
 
374 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
374 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  49.46 
 
 
359 aa  358  6e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  48.52 
 
 
373 aa  347  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  39.94 
 
 
371 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.93 
 
 
376 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
381 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  38.32 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
384 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
375 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
378 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 
378 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
379 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  39.79 
 
 
387 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
365 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
374 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
374 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  41.01 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  37.77 
 
 
378 aa  262  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
374 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  37.57 
 
 
379 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  36.1 
 
 
377 aa  262  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  37.57 
 
 
379 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  37.57 
 
 
379 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
377 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  37.13 
 
 
378 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
377 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  36.97 
 
 
377 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
376 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.51 
 
 
375 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.73 
 
 
377 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
378 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
380 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.34 
 
 
381 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 
382 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  35.03 
 
 
368 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  38.86 
 
 
385 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  39.25 
 
 
376 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  35.03 
 
 
368 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
372 aa  258  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
378 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  38.56 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  36.41 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  36.41 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  36.41 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  36.15 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  36.53 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  36.15 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  37.3 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  36.15 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  36.15 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  38.73 
 
 
375 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  39.69 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  37.33 
 
 
375 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  35.93 
 
 
376 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  36.1 
 
 
374 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  34.75 
 
 
376 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
389 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  37.92 
 
 
380 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 
376 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  36.24 
 
 
376 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
377 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  40.67 
 
 
372 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
377 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
379 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
376 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  37.82 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  38.1 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  38.12 
 
 
371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  36.24 
 
 
378 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  36.24 
 
 
378 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  36.24 
 
 
378 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  35.94 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>