More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0562 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
376 aa  771    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  58.4 
 
 
362 aa  450  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  58.13 
 
 
380 aa  418  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  53.7 
 
 
373 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
374 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
373 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
374 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
373 aa  386  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
359 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  40.69 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  40.69 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
382 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
379 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
379 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
378 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
378 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
389 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
377 aa  289  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
377 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
377 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  39.57 
 
 
375 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  40.53 
 
 
378 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  40.8 
 
 
378 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  40.96 
 
 
376 aa  285  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  39.14 
 
 
374 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 
378 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  40.64 
 
 
378 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  39.04 
 
 
376 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
379 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 
372 aa  279  4e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
371 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  38.56 
 
 
375 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0027  chaperone protein DnaJ  39.36 
 
 
374 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  38.67 
 
 
387 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
374 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
374 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  39.01 
 
 
374 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
374 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
376 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  41.38 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0034  chaperone protein DnaJ  40.53 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.953723  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
376 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  38.13 
 
 
377 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  39.31 
 
 
375 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  41.64 
 
 
377 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 
375 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  38.24 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
373 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  38.48 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  38.73 
 
 
377 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  39.78 
 
 
384 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.46 
 
 
381 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  38.77 
 
 
372 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
397 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
375 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  39.68 
 
 
375 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
386 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
369 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  39.05 
 
 
385 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 
378 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  41.01 
 
 
373 aa  262  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
380 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
376 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  41.53 
 
 
369 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  37.77 
 
 
378 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  37.11 
 
 
374 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  38.4 
 
 
381 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
377 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
377 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  36.7 
 
 
379 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  38.64 
 
 
381 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>