More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2059 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
376 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  70.79 
 
 
380 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  70.45 
 
 
378 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  54.13 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
375 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  54.93 
 
 
380 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  52.99 
 
 
379 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  53.05 
 
 
375 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  53.15 
 
 
379 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 
386 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  51.35 
 
 
372 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  54.18 
 
 
376 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
381 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  53.01 
 
 
379 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
377 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  52.55 
 
 
383 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  52.15 
 
 
380 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
385 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
385 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  51.73 
 
 
377 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  53.28 
 
 
379 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  53.64 
 
 
375 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
377 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  52.69 
 
 
377 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  53.83 
 
 
382 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 
387 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
378 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 
388 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
382 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  51.07 
 
 
376 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  51.19 
 
 
385 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
376 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
376 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
379 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
379 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
379 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
379 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  48.81 
 
 
382 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
379 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
388 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
378 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  48.55 
 
 
382 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
382 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
376 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  48.81 
 
 
385 aa  358  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
378 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
382 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
375 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  47.33 
 
 
372 aa  352  5e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
375 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
379 aa  351  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
379 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
379 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  46.72 
 
 
385 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.25 
 
 
377 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  48.65 
 
 
373 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
389 aa  348  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  50.94 
 
 
374 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  51.21 
 
 
374 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  50.94 
 
 
374 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
375 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  48.54 
 
 
379 aa  345  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  50.94 
 
 
397 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  49.34 
 
 
382 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
380 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  47.71 
 
 
374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  49.2 
 
 
377 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  48.16 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  49.07 
 
 
381 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
376 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  48.12 
 
 
373 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  48.8 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  48.8 
 
 
377 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  49.07 
 
 
381 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  49.19 
 
 
375 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
376 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  48.53 
 
 
377 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  48.8 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  48.94 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  51.46 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  47.07 
 
 
380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  46.93 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  46.65 
 
 
380 aa  335  5.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
375 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>