88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0931 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  68.03 
 
 		 492 aa  637    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 469 aa  927    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  67.88 
 
 		 473 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  63.38 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  61.72 
 
 		 515 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.28 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  50.43 
 
 		 461 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  50.75 
 
 		 469 aa  428  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  40.75 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  40.31 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  38.35 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  38.17 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  38.7 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  37.8 
 
 		 465 aa  250  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  35.73 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  34.96 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  34.65 
 
 		 467 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  35.79 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  33.19 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  33.77 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  32.97 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.75 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  32.91 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  29.15 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  28.94 
 
 		 431 aa  183  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  28.72 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  29.21 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  27.39 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  28.88 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  26.38 
 
 		 459 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  26.78 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  30.94 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  25.87 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  27.74 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  36.99 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.91 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.94 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.91 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.57 
 
 		 610 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.44 
 
 		 989 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.71 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0436737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.29 
 
 		 632 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.06 
 
 		 577 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.61 
 
 		 732 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.7 
 
 		 811 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.56 
 
 		 955 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.47 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.47 
 
 		 814 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.11 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.76 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  28.34 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.32 
 
 		 1035 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  26.67 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.61 
 
 		 560 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0055  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 523 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.17 
 
 		 574 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.48 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0030  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.89 
 
 		 523 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0028  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.4 
 
 		 523 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.85142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1214  phosphoesterase RecJ domain protein  26.46 
 
 		 545 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0990291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.32 
 
 		 574 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.8 
 
 		 757 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.8 
 
 		 757 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.75 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.75 
 
 		 857 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.96 
 
 		 801 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0768  phosphoesterase RecJ domain protein  20.92 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.33 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  25.5 
 
 		 606 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.26 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  26.73 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.74 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.24 
 
 		 578 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.91 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  28.21 
 
 		 758 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.51 
 
 		 1120 aa  45.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.13 
 
 		 977 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.26 
 
 		 568 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  25.43 
 
 		 756 aa  44.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  24.87 
 
 		 932 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1157  RecJ exonuclease  29.9 
 
 		 632 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.884679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  27.13 
 
 		 722 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.85 
 
 		 580 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.32 
 
 		 865 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.73 
 
 		 582 aa  43.1  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.65 
 
 		 572 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.74 
 
 		 613 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>