56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2510 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  100 
 
 
408 aa  837    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  43.63 
 
 
405 aa  317  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  43.29 
 
 
405 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  40.76 
 
 
399 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  44.12 
 
 
402 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.37 
 
 
437 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  30.42 
 
 
452 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  31.04 
 
 
427 aa  169  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.33 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.11 
 
 
461 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  26.32 
 
 
469 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  28.74 
 
 
469 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  25.54 
 
 
477 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  25.76 
 
 
492 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  24.82 
 
 
420 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  24.27 
 
 
431 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  23.67 
 
 
432 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  24.23 
 
 
473 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  23.3 
 
 
431 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  23.54 
 
 
459 aa  92.8  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  24.68 
 
 
500 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  23.3 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  25.47 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  26.04 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  26.32 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  25.11 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  27.35 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  25.07 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  33.52 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  33.14 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  32.18 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  29.71 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  32.77 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  30.13 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  34.91 
 
 
468 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.41 
 
 
611 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.19 
 
 
619 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.61 
 
 
597 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.43 
 
 
600 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 
597 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.17 
 
 
611 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.49 
 
 
573 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.05 
 
 
611 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.62 
 
 
579 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.59 
 
 
788 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.23 
 
 
702 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.41 
 
 
566 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.84 
 
 
779 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.01 
 
 
566 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>