More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0292 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 577 aa  1172    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.09 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.42 
 
 		 568 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.28 
 
 		 580 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0780382 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.56 
 
 		 574 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.08 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.96 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.07 
 
 		 573 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.51 
 
 		 574 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37 
 
 		 572 aa  356  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.93 
 
 		 814 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.52 
 
 		 587 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.67 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.45 
 
 		 907 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.15 
 
 		 831 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.41 
 
 		 885 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.45 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 811 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  33.92 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.64 
 
 		 599 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  35.63 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.35 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.28 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 572 aa  332  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.45 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.33 
 
 		 573 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.32 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.42 
 
 		 570 aa  324  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.33 
 
 		 573 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.44 
 
 		 564 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.69 
 
 		 827 aa  320  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.89 
 
 		 566 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.1 
 
 		 566 aa  317  5e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.83 
 
 		 798 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.69 
 
 		 732 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 989 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.66 
 
 		 932 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.71 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  33.7 
 
 		 730 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 		 584 aa  310  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  35.11 
 
 		 684 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  31.41 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 568 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.26 
 
 		 571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  37.75 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  33.11 
 
 		 701 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.47 
 
 		 977 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 1134 aa  300  6e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.8 
 
 		 573 aa  300  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  34.7 
 
 		 568 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.12 
 
 		 864 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.87 
 
 		 564 aa  296  9e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.03 
 
 		 655 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.03 
 
 		 655 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  36.1 
 
 		 569 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.52 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 955 aa  294  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.7 
 
 		 788 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  36.19 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.91 
 
 		 955 aa  293  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  36.72 
 
 		 606 aa  293  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  35.65 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  35.65 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.42 
 
 		 773 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.54 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.81 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.51 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  35.36 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 1120 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  35.36 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  35.66 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  35.36 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  35.36 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 1035 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 569 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  35.36 
 
 		 577 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.31 
 
 		 592 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.64 
 
 		 592 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.84 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.42 
 
 		 779 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  35.86 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  36.38 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.76 
 
 		 579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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