More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0054 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 584 aa  1198    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.69 
 
 		 568 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  47.89 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.97 
 
 		 584 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.48 
 
 		 567 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.35 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  46.76 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.22 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.12 
 
 		 564 aa  525  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  43.49 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.38 
 
 		 587 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.37 
 
 		 568 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.39 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.92 
 
 		 907 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  40.33 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.38 
 
 		 885 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.79 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.82 
 
 		 827 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37 
 
 		 814 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.89 
 
 		 571 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.34 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.46 
 
 		 801 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.02 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.2 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  35.95 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.02 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.59 
 
 		 932 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 773 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 811 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.02 
 
 		 779 aa  365  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.18 
 
 		 779 aa  365  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.66 
 
 		 779 aa  364  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.4 
 
 		 785 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.34 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.36 
 
 		 574 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.13 
 
 		 573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.82 
 
 		 573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 592 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 592 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 583 aa  349  9e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 788 aa  349  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  37.77 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.79 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.01 
 
 		 586 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.8 
 
 		 579 aa  343  7e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.26 
 
 		 798 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.95 
 
 		 831 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.17 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.49 
 
 		 566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 742 aa  339  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 564 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.62 
 
 		 566 aa  334  3e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.62 
 
 		 566 aa  334  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.33 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.8 
 
 		 579 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.84 
 
 		 578 aa  332  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 		 732 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 		 573 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.07 
 
 		 599 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  37.04 
 
 		 592 aa  326  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.25 
 
 		 883 aa  325  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.84 
 
 		 989 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.53 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  32.82 
 
 		 684 aa  321  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 577 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 577 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 577 aa  320  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.64 
 
 		 655 aa  316  8e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 1102 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  34.75 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 577 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  33.74 
 
 		 577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  33.74 
 
 		 577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 577 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  33.74 
 
 		 577 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 577 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 577 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 		 654 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.56 
 
 		 911 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36 
 
 		 1035 aa  309  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.48 
 
 		 569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.44 
 
 		 757 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  31.76 
 
 		 730 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 576 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  31.83 
 
 		 736 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.21 
 
 		 1134 aa  301  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.09 
 
 		 576 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 857 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 573 aa  300  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.09 
 
 		 823 aa  300  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
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